| 人工鱼群算法在基因调控网络中的应用研究 |
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| 引用本文： | 田旺兰,李加升.人工鱼群算法在基因调控网络中的应用研究[J].计算机工程,2014(10). |
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| 作者姓名： | 田旺兰 李加升 |
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| 作者单位： | 湖南城市学院通信与电子工程学院,湖南 益阳,413000 |
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| 基金项目： | 湖南省科技计划基金资助项目(2012FJ3025)。 |
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| 摘 要： | 在分析基因调控网络现状及优缺点的基础上,提出利用人工鱼群算法对阈值布尔网络模型构建下的基因调控网络进行研究。将阈值布尔网络模型应用于花发育形态模型,构建基于预定义吸引子和极限环的综合网络。比较人工鱼群算法与模拟退火算法在基因调控网络中的应用情况,分析网络节点更新机制变化时布尔网络保留吸引子的能力,发现在极限环长度为2和特定网络拓扑下网络才具有鲁棒性。实验结果表明,与模拟退火算法相比,人工鱼群算法在网络发现、鲁棒性方面具有更好的性能,因此利用人工鱼群算法学习布尔网络结构是有效可行的。
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| 关 键 词： | 人工鱼群算法 模拟退火算法 布尔网络 吸引子 极限环 花发育形态模型 |
Research on Application of Artificial Fish Swarm Algorithm in Gene Regulatory Network |
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| TIAN Wang-lan,LI Jia-sheng.Research on Application of Artificial Fish Swarm Algorithm in Gene Regulatory Network[J].Computer Engineering,2014(10). |
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| Authors: | TIAN Wang-lan LI Jia-sheng |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Artificial Fish Swarm Algorithm ( AFSA ) Simulated Annealing ( SA ) algorithm Boolean network attractor limit circle flower growth morphogenesis model |
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