| P38促细胞分裂蛋白酶活性抑制剂的分子对接及3D-QSAR研究(英文) |
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| 引用本文： | 沈勇,王源丰,吴景恒,肖利民.P38促细胞分裂蛋白酶活性抑制剂的分子对接及3D-QSAR研究(英文)[J].计算机与应用化学,2012,29(12):1409-1415. |
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| 作者姓名： | 沈勇 王源丰 吴景恒 肖利民 |
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| 作者单位： | 1. 中山大学化学与化学工程学院,广东,广州,510275,中国
2. 北京航空航天大学计算机学院,北京,100191,中国 |
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| 基金项目： | Guangdong Province Key Laboratory of Computational Science and the Guangdong Province Computational Science Innovative Research Team.国家自然科学基金资助项目 |
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| 摘 要： | 运用分子对接方法研究了26个以嘧啶基咪唑环为基底的一系列同源化合物与p38促细胞分裂蛋白酶晶体结构的结合模式。采用比较分子力场分析法(CoMFA)对选取的对接优势构象进行三维定量构效关系(3D-QSAR)研究。建立了3D-QSAR的CoMFA模型,其非交叉验证系数r~2为0.986,交叉验证相关系数q~2为0.755,外部验证的标准偏差(SD为0.13,表明该模型合理、可信,并具有良好的预测能力。有趣的是,配体与活性周围氨基酸残基4个距离之和与其活性之间具有良好的线性关系(R~2=0.752),揭示了配体分子大小及与氨基酸残基结合的紧密程度对化合物的抑制活性起着主要的作用。最后,根据研究总结的规律设计了4个具有潜在高活性的嘧啶基咪唑衍生物。研究结果可为实验工作者合成新药提供理论有意义的理论参考。
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| 关 键 词： | 咪唑化合物 p38促细胞分裂蛋白酶 3D-QSAR 比较力场分析 分子对接 |
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