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BP神经网络在蛋白质二级结构预测中的应用
引用本文:王菲露,宋杰,宋杨.BP神经网络在蛋白质二级结构预测中的应用[J].计算机技术与发展,2009,19(5).
作者姓名:王菲露  宋杰  宋杨
作者单位:1. 安徽大学,计算智能与信号处理教育部重点实验室,安徽,合肥,230039;安徽建筑工业学院,电子与信息工程学院,安徽,合肥,230601
2. 安徽大学,计算智能与信号处理教育部重点实验室,安徽,合肥,230039
基金项目:国家自然科学基金,安徽省自然科学基金,安徽省重大自然科学基金 
摘    要:蛋白质结构预测是生物信息学研究的重要问题,而蛋白质二级结构预测是蛋白质结构预测的关键步骤.文中通过BLAST工具得到Identity小于等于35%的46个蛋白质复合物的单链作为数据集,分别采用5位编码和Profile编码,通过不同大小的滑动窗口,对蛋白质二级结构进行预测.实验结果显示,富含"生物进化信息"的Profile编码有着明显的优势,各种精确度均得到了较好的结果,尤其是精确度QE明显高于5位编码的QE.

关 键 词:蛋白质二级结构  BP神经网络  氨基酸序列  5位编码  Profile编码

Application of BP Neural Network in Protein Secondary Structure Prediction
WANG Fei-lu,SONG Jie,SONG Yang.Application of BP Neural Network in Protein Secondary Structure Prediction[J].Computer Technology and Development,2009,19(5).
Authors:WANG Fei-lu  SONG Jie  SONG Yang
Abstract:
Keywords:
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