| 树莓RiPAL1基因克隆及生物信息学分析 |
| |
| 引用本文： | 孙华军,刘盈,李雪静,杨斯琪,钱丽丽,李跃.树莓RiPAL1基因克隆及生物信息学分析[J].现代食品科技,2023,39(9):88-95. |
| |
| 作者姓名： | 孙华军 刘盈 李雪静 杨斯琪 钱丽丽 李跃 |
| |
| 作者单位： | （黑龙江八一农垦大学食品学院，黑龙江大庆 163316） |
| |
| 基金项目： | 黑龙江省自然科学基金联合引导项目（LH2021C067）；黑龙江八一农垦大学引进人才科研启动基金（XYB202102）；黑龙江八一农垦大学大学生创新创业训练计划项目（S202210223002） |
| |
| 摘 要： | 苯丙氨酸解氨酶（Phenylalanine Ammonia Lyase，PAL）是苯丙烷类代谢的关键酶，能调节树莓中黄酮类的生物合成。为了深入研究树莓中RiPAL1基因的功能与调控机制，以树莓果实为材料提取总RNA，合成cDNA第一链，然后成功克隆出树莓果实RiPAL1基因，并对其进行了相关的生物信息学分析。结果表明，RiPAL1基因的编码序列（Coding Sequence，CDS）全长为2 133 bp，编码710个氨基酸，分子量为77.50 ku，等电点为6.21。RiPAL1蛋白疏水性最大值为4.50，最小值为-4.50，平均疏水指数为-0.49，为亲水性蛋白，无跨膜结构，无信号肽。含有4个N糖基化位点和67个特异性激酶位点，二级结构以α螺旋为主，三级结构为同型四聚体。多序列比对显示RiPAL1蛋白具有典型的苯丙氨酸解氨酶保守结构域，系统进化分析表明RiPAL1蛋白与同科植物草莓亲缘关系最近。该研究可为深入研究RiPAL1基因参与树莓果实黄酮类物质生物合成的分子机制提供参考。
|
| 关 键 词： | 树莓 苯丙氨酸解氨酶（PAL） 基因克隆 生信分析 黄酮 |
| 收稿时间： | 2022/9/19 0:00:00 |
Cloning and Bioinformatics Analysis of RiPAL1 Gene of Raspberry |
| |
| SUN Huajun,LIU Ying,LI Xuejing,YANG Siqi,QIAN Lili,LI Yue.Cloning and Bioinformatics Analysis of RiPAL1 Gene of Raspberry[J].Modern Food Science & Technology,2023,39(9):88-95. |
| |
| Authors: | SUN Huajun LIU Ying LI Xuejing YANG Siqi QIAN Lili LI Yue |
| |
| Affiliation: | (College of Food Science, Heilongjiang Bayi Agricultural University, Daqing 163316, China) |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | raspberry phenylalanine ammonia-lyase (PAL) gene cloning bioinformatics analysis flavonoids |
|
| 点击此处可从《现代食品科技》浏览原始摘要信息 |
|
点击此处可从《现代食品科技》下载全文 |
