| 应用PCR-DGGE技术分析长江口低氧区的细菌群落组成 |
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| 引用本文： | 刘敏,王子峰,朱开玲,李洪波,高绪敏,邓兵,肖天. 应用PCR-DGGE技术分析长江口低氧区的细菌群落组成[J]. 高技术通讯, 2008, 18(6): 650-656. DOI: 10.3772/j.issn.1002-0470.2008.06.018 |
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| 作者姓名： | 刘敏 王子峰 朱开玲 李洪波 高绪敏 邓兵 肖天 |
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| 作者单位： | 中国科学院海洋研究所海洋生态与环境科学重点实验室,青岛,266071;中国科学院研究生院,北京,100864;中国科学院海洋研究所海洋生态与环境科学重点实验室,青岛,266071;中国科学院海洋研究所海洋生态与环境科学重点实验室,青岛,266071;国家海洋环境监测中心,大连,116023;华东师范大学河口海岸国家重点实验室,上海,200062 |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究发展计划(973计划) , 国家自然科学基金 , 中国科学院知识创新工程项目 |
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| 摘 要： | 应用PCR结合变性梯度凝胶电泳（PCR-DGGE）技术对长江口外低氧区的细菌群落组成和优势菌群进行了分析。对25条DGGE条带进行了克隆、测序，所得到的细菌16SrDNA基因V3区序列进行了系统进化分析。结果显示这25条条带分别归属于4个细菌类群：变形菌门（Proteobacteria）、拟杆菌门（Bacteroides）、厚壁菌门（Finnicutes）和蓝细菌门（Cyanobacteria）。其中有16条分别与变形细菌亚群的γ-Proteobacteria和δ-Proteobacteria相似。时空分析发现，低氧水体的细菌群落组成与非低氧水体的组成不同，低氧水体包括变形菌门（Proteobacteria）、拟杆菌门（Bacteroides）、厚壁菌门（Finnicutes）和蓝细菌门（Cyanobacteria），非低氧水体中没有发现蓝细菌门（Cyanobacteria）。并且8月份低氧水体中Flavobacteria为优势菌群。
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| 关 键 词： | 细菌群落组成 16S rDNA序列分析 PCR-DGGE 长江口低氧区 |
Bacterial community composition in the Changjiang estuary's hypoxia studied by PCR-denaturing gradient gel electrophoresis |
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| Liu Min,Wang Zifeng,Zhu Kailing,Li Hongbo,Gao Xumin,Deng Bing,Xiao Tian. Bacterial community composition in the Changjiang estuary's hypoxia studied by PCR-denaturing gradient gel electrophoresis[J]. High Technology Letters, 2008, 18(6): 650-656. DOI: 10.3772/j.issn.1002-0470.2008.06.018 |
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| Authors: | Liu Min Wang Zifeng Zhu Kailing Li Hongbo Gao Xumin Deng Bing Xiao Tian |
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| Affiliation: | ***;****;***;****;* Key Laboratory of Marine Ecology & Environmental Sciences;Institute of Oceanology;Chinese Academy of Sciences;Qingdao 266071;** Graduate School of the Chinese Academy of Sciences;Beijing 100864;*** National Marine Environmental Monitoring Center;Dalian 116023;**** State Key Laboratory of Estuarine and Coastal Research;East China Normal University;Shanghai 200062 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | bacterial community composition 16S rDNA phylogenetic analysis PCR-DGGE hypoxia in Changjiang estuary |
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