| HMG-CoA还原酶抑制剂的虚拟筛选模型的建立 |
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| 引用本文： | 吴萍,孔德信.HMG-CoA还原酶抑制剂的虚拟筛选模型的建立[J].计算机与应用化学,2009,26(11). |
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| 作者姓名： | 吴萍 孔德信 |
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| 作者单位： | 1. 山东理工大学化学工程学院,山东,淄博,255091
2. 山东省生物信息工程技术研究中心,山东理工大学生命科学学院,山东,淄博,255091 |
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| 基金项目： | 山东理工大学博士科研启动基金(4041-405019);;山东理工大学生命科学学院特色学科项目的资助 |
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| 摘 要： | HMG-CoA还原酶(简称HMGR)是降血脂药物设计的重要靶标,抑制该酶的活性可以有效地降低血浆总胆固醇水平,从而降低罹患心脑血管疾病的几率。虽然已经有数种他汀类药物作为HMGR抑制剂应用于临床,但是他汀类药物的安全性,特别是长期服用的安全性一直备受关注,所以设计新型安全的HMGR抑制剂仍然十分迫切。论文根据hHMGR的晶体结构,利用Dock、FlexX、Autodock 3个程序建立了hHMGR抑制剂的虚拟筛选模型,模型的可靠性通过重复晶体结构、对比对接打分和化合物的活性之间的相关性等方法得以验证,最后,分析各种对接软件的特点,指出了hHMGR抑制剂虚拟筛选,特别是目筛中应当注意的问题,以期为新型HMGR抑制剂的设计提供指导。
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| 关 键 词： | HMGR抑制剂 Dock FlexX Autodock 虚拟筛选 |
The establishment of virtual screening models for the discovery of HMG-CoA reductase inhibitors |
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| Wu Ping,Kong Dexin.The establishment of virtual screening models for the discovery of HMG-CoA reductase inhibitors[J].Computers and Applied Chemistry,2009,26(11). |
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| Authors: | Wu Ping Kong Dexin |
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| Affiliation: | 2*;1.College of Chemical Engineering;Shandong University of Technology;Zibo;255091;Shandong;China;2.Shandong Provincial Research Center for Bioinformatics Engineering and Technique;College of Life Science;China |
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| Abstract: | Elevated concentration of plasma cholesterol was a major risk factor for the development of coronary heart disease.3-hydroxy -3-methyl-glutaryl-CoA reductase(HMGR),the natural target and the rate-limiting enzyme in the cholesterol biosynthetic pathway, was an attractive target in the searching for drugs to reduce plasma cholesterol concentrations.In this paper,based on hHMGR protein crystal structure,by using the three programs Dock,FlexX,and Autodock,virtual screening models for hHMGR inhibitors were const... |
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| Keywords: | HMGR inhibitor Dock FlexX Autodock Virtual screening |
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