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PCR-DGGE在真菌群落研究中的应用解析
引用本文:翟祖欢.PCR-DGGE在真菌群落研究中的应用解析[J].齐齐哈尔轻工业学院学报,2010(3):57-61.
作者姓名:翟祖欢
作者单位:大庆师范学院学生工作处,黑龙江大庆163712
基金项目:教育部新世纪优秀人才资助计划项目(NCET-05-0330)
摘    要:论述了变性梯度凝胶电泳(DGGE)在真菌群落结构研究中的技术应用的主要步骤:从样品中直接提取真菌DNA,选取5′端含GC夹的特异性引物对18S rDNA或IST序列等的部分片段进行扩增,得到合适的目的DNA片段,并在变性梯度的聚丙烯酰胺凝胶中进行电泳,使不同来源的真菌DNA片段有效分离,再进行各种分类分析。

关 键 词:真菌  变性梯度凝胶电泳  聚合酶链式反应  GC夹

Protocols of application of PCR-DGGE in studies of fungal community
Authors:ZHAI Zu-huan
Affiliation:ZHAI Zu-huan(Studentwork Deparment,Daqing Normal University,Heilongjiang Daqing 163712,China)
Abstract:Introducing detailed procedures for the application denaturing gradient gel electrophoresis(DGGE) in the study of fungal community.The main procedure for DGGE includes: Extracting DNA directly from samples,PCR in the region of 18SrDNA or IST sequence using a primer with GC clamp in 5′,analyzing the PCR products in denaturing gradient polyacrylamide gel with a chemical denaturing gradient which could separate the different DNA fragments and then extracting bands from the gel.
Keywords:fungal  DGGE  PCR  GC clamp
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