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代谢途径参数估计的智能优化算法比较
引用本文:余永红,冯斌,孙俊. 代谢途径参数估计的智能优化算法比较[J]. 计算机与应用化学, 2010, 27(7)
作者姓名:余永红  冯斌  孙俊
作者单位:江南大学信息工程学院,江苏,无锡,214036
基金项目:国家自然科学基金资助项目 
摘    要:本文讨论了非线性动力生化过程的参数估计(反问题),以1个包含36个参数的3阶段代谢途径为研究对象,其数学模型描述为受1组非线性代数一微分方程约束的非线性规划问题.由于频繁的病态和多峰值,传统的算法(如梯度算法)并不能得到满意的解.智能优化算法由于其高效性、收敛性和鲁棒性等特点被广泛应用于非线件问题优化,于是提出利用智能优化算法求解代谢途径的参数估计,利用算法的非线性逼近能力,建立求解参数估计的算法模型,采用人工模拟实验值,通过改变已知参数值增加试验次数减少实验误差,将参数编码成算法的1组解向量,以实验值和预测值的误差平方加权的和为日标优化函数.仿真试验表明用量子粒子群算法求解较好,该算法有效地估计了模型中的36个参数,并且成功地完成了对已知模型的预测.

关 键 词:智能优化算法  代谢途径  参数估计

A comparison of intelligent optimization algorithms for parameter estimation in metabolic pathways
Yu Yonghong,Feng Bin,Sun Jun. A comparison of intelligent optimization algorithms for parameter estimation in metabolic pathways[J]. Computers and Applied Chemistry, 2010, 27(7)
Authors:Yu Yonghong  Feng Bin  Sun Jun
Abstract:
Keywords:
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