| 嵌合抗CD_(20)抗体Fab’片段三维结构的同源模建 |
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| 引用本文： | 彭晖,杨纯正,范冬梅,郑梦杰,赖增祖,熊冬生,朱祯平. 嵌合抗CD_(20)抗体Fab’片段三维结构的同源模建[J]. 高技术通讯, 2001, 0(12) |
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| 作者姓名： | 彭晖 杨纯正 范冬梅 郑梦杰 赖增祖 熊冬生 朱祯平 |
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| 作者单位： | 中国医学科学院中国协和医科大学血液学研究所实验血液学国家重点实验室，中国医学科学院中国协和医科大学血液学研究所实验血液学国家重点实验室，中国医学科学院中国协和医科大学血液学研究所实验血液学国家重点实验室，中国医学科学院中国协和医科大学血液学研究所实验血液学国 |
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| 基金项目： | 86 3计划 ( 86 3 10 2 0 9 0 3 0 3)，国家自然科学基金 ( 3990 0 186 )资助项目 |
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| 摘 要： | 分别以抗CD2 0 Fab’轻链和Fd段的氨基酸一级序列为探针 ,在PDB数据库中搜寻与其同源性高的蛋白作为参考蛋白 ,利用InsightII/MSI的同源蛋白质结构模建系统(homology)在SGI计算机图形工作站上模建轻链和Fd段的三维空间结构后 ,搭建成抗CD2 0 嵌合抗体片段Fab’的空间构象 ,并对模建蛋白进行分子力学和分子动力学优化。对优化后的模建蛋白的合理性验证显示 ,模建蛋白的三维结构是合理而可信的。
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| 关 键 词： | 同源模建 CD20 抗体Fab’片段 |
Homology Modeling of Anti-CD_(20) Chimeric Fab' Fragment |
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| Peng Hui,Yang Chunzheng,Fan Dongmei,Zheng Mengjie,Lai Zengzu,Xiong Dongsheng,Zhu Zhenping. Homology Modeling of Anti-CD_(20) Chimeric Fab' Fragment[J]. High Technology Letters, 2001, 0(12) |
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| Authors: | Peng Hui Yang Chunzheng Fan Dongmei Zheng Mengjie Lai Zengzu Xiong Dongsheng Zhu Zhenping |
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| Abstract: | In our study, the three dimensional structure of anti-CD 20 Fab' fragment was modeled by computer-aided molecular design system MODELER developed by Insight II. The PDB library was searched for homologious protein using the amino acid primary sequence of anti-CD 20 chimeric antibody L chain and Fd domain as probe. The homology modeling of Fd and L chain domains of anti-CD 20 Fab' fragment was reported, and the whole three-dimensional structure of the Fab' was constructed. Then the model structure was refined by the methods of molecular mechanics and dynamics. The optimized structure was proved reasonable by Profile-3D program. |
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| Keywords: | Homology modeling CD 20 Fab' fragment |
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