| HIV-1蛋白酶与TMC114结合口袋内水分子作用的研究 |
| |
| 引用本文： | 时术华,张庆刚. HIV-1蛋白酶与TMC114结合口袋内水分子作用的研究[J]. 山东建筑大学学报, 2010, 25(4) |
| |
| 作者姓名： | 时术华 张庆刚 |
| |
| 作者单位： | 1. 山东建筑大学,理学院,山东,济南,250101
2. 山东师范大学,物理与电子科学学院,山东,济南,250014 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金项目，高等学校博士学科点专项科研基金，山东省自然科学基金重点项目 |
| |
| 摘 要： | 水分子在生物分子的稳定、动力学和功能方面发挥着重要作用。采用3ns分子动力学模拟,从不同侧面系统地研究了H IV-1蛋白酶与其抑制剂TMC114结合口袋内的五个水分子的功能作用。结果表明:水分子可以保持PR-TMC114的动力学和结构以及绑定特性的稳定;复合体的晶体结构和平均结构的比较表明W at301、W at2和W at5在分子动力学模拟过程中是守恒的;对氢键的分析证实W at301可以稳定PR与TMC114抑制剂柔性区域的结构,并且W at2和W at5能增强活动位点的稳定性。
|
| 关 键 词： | 物理化学 结合口袋 分子动力学 HIV-1蛋白酶 |
Study on the function of water molecules buried within binding pocket of HIV-1 protease and TMC114 |
| |
| SHI Shu-hua,ZHANG Qing-gang. Study on the function of water molecules buried within binding pocket of HIV-1 protease and TMC114[J]. Journal of Shandong Institute of Architecture and Engineering, 2010, 25(4) |
| |
| Authors: | SHI Shu-hua ZHANG Qing-gang |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | TMC114 |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
|
