| 基于标准结构熵的PPI网络可靠性研究* |
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| 引用本文： | 李敏,陈建二,王建新.基于标准结构熵的PPI网络可靠性研究*[J].计算机应用研究,2009,26(1):97-98. |
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| 作者姓名： | 李敏 陈建二 王建新 |
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| 作者单位： | 中南大学,信息科学与工程学院,长沙,410083 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金重点资助项目（60433020）；新世纪优秀人才支持计划资助项目（NCET-05-0683）；长江学者和创新团队发展计划资助项目（IRT0661） |
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| 摘 要： | 由蛋白质相互作用构成的PPI网络的拓扑特性分析是后基因组时代最重要的研究课题之一。应用标准网络结构熵对DIP数据库中七个物种的八个PPI网络的异质性和可靠性进行分析与研究。分析结果表明，这些PPI网络具有典型的无尺度特性，对随机移除不超过10%的顶点都具有很好的鲁棒性，但对有选择地移除2%的高度顶点就开始表现出极弱的抗攻击性。
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| 关 键 词： | 系统生物学 蛋白质相互作用网络 鲁棒性 脆弱性 熵 |
Research on robustness of PPI networks based on normalized entropy |
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| LI Min,CHEN Jian-er,WANG Jian-xin.Research on robustness of PPI networks based on normalized entropy[J].Application Research of Computers,2009,26(1):97-98. |
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| Authors: | LI Min CHEN Jian-er WANG Jian-xin |
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| Affiliation: | (School of Information Science & Engineering, Central South University, Changsha 410083, China) |
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| Abstract: | Analysis of the topology characters of PPI network composed of protein-protein interactions is one of the most important issues in the post-genomic era. This paper analyzed the heterogeneity and robustness of 8 PPI networks of 7 species in DIP database by using ormalized entropy. Analysis shows that these PPI networks are all scale-free, which are robust against the random removal of not more than 10% nodes, but are vulnerable to the removal of 2% nodes of high degree. |
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| Keywords: | system biology protein-protein interaction network robustness lethality entropy |
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