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TaqMan-MGB探针实时荧光定量PCR检测克罗诺杆菌MMS基因方法的建立
引用本文:谭翰清,蔡建生,谭海芳,林凤,程洁萍.TaqMan-MGB探针实时荧光定量PCR检测克罗诺杆菌MMS基因方法的建立[J].中国食品卫生杂志,2014,26(1):40-44.
作者姓名:谭翰清  蔡建生  谭海芳  林凤  程洁萍
作者单位:广东省肇庆市疾病预防控制中心,广东 肇庆 526060;广东省肇庆市疾病预防控制中心,广东 肇庆 526060;广东省肇庆市疾病预防控制中心,广东 肇庆 526060;广东省肇庆市疾病预防控制中心,广东 肇庆 526060;广东省肇庆市疾病预防控制中心,广东 肇庆 526060
基金项目:广东省肇庆市科技创新计划项目(2013E1810)
摘    要:建立克罗诺杆菌的特异、灵敏的TaqMan-MGB探针实时荧光定量PCR检测方法。方法 根据GenBank公布的克罗诺杆菌MMS基因高保守序列,设计特异引物和TaqMan-MGB探针,建立和优化反应体系,用25种其他常见致病菌评价反应体系的特异性,用克罗诺杆菌MMS基因重组质粒构建实时荧光定量PCR标准曲线,对重组质粒、纯菌和人工模拟污染样本进行灵敏度试验,并与FDA推荐的TaqMan探针实时荧光PCR比较,配对t检验分析两种方法对Ct值和荧光强度的差异。结果 采用TaqMan-MGB探针实时荧光定量PCR检测克罗诺杆菌MMS基因仅需40min,与25种非目标菌无交叉反应,仅对克罗诺杆菌有特异性扩增;所构建方法线性关系良好,相关系数r2=0.999,扩增效率为99.972%,对重组质粒、纯菌、人工模拟污染样品标本的灵敏度分别达10拷贝/反应、3.8和38cfu/ml;与FDA推荐的TaqMan探针实时荧光PCR相比,TaqMan-MGB探针实时荧光定量PCR的Ct值更小、△Rn值更高,灵敏度和分辨率差异均有统计学意义(Ct:t=-14.406,P﹤0.01;△Rn:t=14.230,P﹤0.01)。结论 本研究建立的TaqMan-MGB探针实时荧光定量PCR反应体系能够快速、特异、灵敏地检测克罗诺杆菌MMS基因,可用于婴幼儿奶粉中克罗诺杆菌的快速筛查和鉴定,具有较大的的应用价值和推广价值。

关 键 词:克罗诺杆菌(原阪崎肠杆菌)    实时荧光定量PCR    TaqMan-MGB探针    局部大分子合成操作子    MMS基因    食源性致病菌    食品安全
收稿时间:2013/9/22 0:00:00

Establishment of quantitative real-time PCR targeting the MMS gene of Cronobacter spp. based on TaqMan-MGB probe
TAN Han-qing,CAI Jian-sheng,TAN Hai-fang,LIN Feng and CHENG Jie-ping.Establishment of quantitative real-time PCR targeting the MMS gene of Cronobacter spp. based on TaqMan-MGB probe[J].Chinese Journal of Food Hygiene,2014,26(1):40-44.
Authors:TAN Han-qing  CAI Jian-sheng  TAN Hai-fang  LIN Feng and CHENG Jie-ping
Affiliation:Zhaoqing Center for Disease Control and Prevention,Guangdong Zhaoqing 526060,China;Zhaoqing Center for Disease Control and Prevention,Guangdong Zhaoqing 526060,China;Zhaoqing Center for Disease Control and Prevention,Guangdong Zhaoqing 526060,China;Zhaoqing Center for Disease Control and Prevention,Guangdong Zhaoqing 526060,China;Zhaoqing Center for Disease Control and Prevention,Guangdong Zhaoqing 526060,China
Abstract:
Keywords:
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