| 皂苷类似物与肾素的分子对接和结合能分析 |
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| 引用本文： | 张海玲,光翠娥,江波,汪俊卿,桑尚源. 皂苷类似物与肾素的分子对接和结合能分析[J]. 食品与生物技术学报, 2014, 33(10): 1056-1062 |
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| 作者姓名： | 张海玲 光翠娥 江波 汪俊卿 桑尚源 |
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| 作者单位： | 1. 食品科学与技术国家重点实验室江南大学,江苏无锡,214122
2. 江南大学生物工程学院,江苏无锡,214122 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目，食品科学与技术国家重点实验室自由探索课题 |
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| 摘 要： | 肾素是治疗高血压疾病的重要靶标之一,对肾素抑制剂大豆皂苷I及其类似物大豆皂苷II、甘草皂苷、单葡萄糖醛酸甘草皂苷元与肾素进行分子对接,采用分子动力学模拟和MMPBSA相结合的方法计算对接复合物的结合自由能,并且对各部分贡献能以及分子间相互作用进行分析。结果表明范德华力和静电相互作用是复合物形成的主要驱动力,S2和S3是肾素和皂苷相互作用重要的活性口袋,Ala229、Asp38、Asp226、Gly228和Tyr83是肾素中与这类抑制剂形成疏水作用的重要氨基酸残基,Ser230、Tyr231、Ser84则可与抑制剂形成氢键。对接结果与皂苷抑制能力吻合性较好,可为新的肾素抑制剂的发现奠定基础。
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| 关 键 词： | 肾素 大豆皂苷I 分子对接 动力学模拟 结合自由能 |
Molecular Docking of Saponin Analogues with Renin and The Analysis of Binding Energy |
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| ZHANG Hailing,GUANG Cuie,JIANG Bo,WANG Junqing and SANG Shangyuan. Molecular Docking of Saponin Analogues with Renin and The Analysis of Binding Energy[J]. Journal of Food Science and Biotechnology, 2014, 33(10): 1056-1062 |
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| Authors: | ZHANG Hailing GUANG Cuie JIANG Bo WANG Junqing SANG Shangyuan |
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| Affiliation: | ZHANG Hailing;GUANG Cuie;JIANG Bo;WANG Junqing;SANG Shangyuan;State Key Laboratory of Food Science & Technology,Jiangnan University;School of Biotechnology,Jiangnan University; |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | renin soyasaponin Ⅰ molecular docking dynamics simulation binding free energy |
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