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双孢蘑菇中一种4R型MYB转录因子的基因克隆和生物信息学分析
引用本文:刘翔,赵紫璇,赵月盈,赵诗睿,贾子怡,姜含越,袁帅,孟德梅. 双孢蘑菇中一种4R型MYB转录因子的基因克隆和生物信息学分析[J]. 食品研究与开发, 2024, 45(2): 185-194
作者姓名:刘翔  赵紫璇  赵月盈  赵诗睿  贾子怡  姜含越  袁帅  孟德梅
作者单位:天津科技大学食品科学与工程学院,天津 300457
基金项目:国家自然科学基金(32372391、31501544);国家级大学生创新创业训练计划资助项目(202310057218)
摘    要:MYB转录因子广泛存在于真核生物中,在植物的生长发育、逆境胁迫等过程中发挥重要作用。与植物相比,对食用菌中MYB转录因子的研究有限。为探究MYB转录因子在食用菌中的生物学功能,对前期转录组发现的一个编码双孢蘑菇(Agaricus bisporus)MYB转录因子的基因进行克隆和生物信息学分析。结果表明,该基因编码区长1 209 bp,翻译402个氨基酸;编码的蛋白分子量为45.95 kDa,等电点9.17,是一种不存在跨膜结构、不含信号肽的亲水性蛋白,具有4个高度保守的SANT结构域,属于4R型MYB转录因子,与白环蘑(Leucoagaricus)中的4RMYB转录因子亲缘关系最近;二级结构预测显示以无规则卷曲和α-螺旋结构为主;亚细胞定位分析显示该转录因子位于细胞核中;此外启动子序列分析表明,该基因启动子区域含有多个与生物抗逆应答、激素响应等相关的顺式作用元件。

关 键 词:双孢蘑菇  MYB转录因子  基因克隆  生物信息学分析  保守结构域
收稿时间:2023-07-21

Gene Cloning and Bioinformatics of a 4R-MYB Transcription Factor in Agaricus bisporus
LIU Xiang,ZHAO Zixuan,ZHAO Yueying,ZHAO Shirui,JIA Ziyi,JIANG Hanyue,YUAN Shuai,MENG Demei. Gene Cloning and Bioinformatics of a 4R-MYB Transcription Factor in Agaricus bisporus[J]. Food Research and Developent, 2024, 45(2): 185-194
Authors:LIU Xiang  ZHAO Zixuan  ZHAO Yueying  ZHAO Shirui  JIA Ziyi  JIANG Hanyue  YUAN Shuai  MENG Demei
Affiliation:College of Food Science and Engineering,Tianjin University of Science&Technology,Tianjin 300457,China
Abstract:
Keywords:
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