| 群体间黑线仓鼠DQA基因exon 2遗传结构分析 |
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| 引用本文： | 孔杰,解学辉,刘璐,薛慧良,徐来祥.群体间黑线仓鼠DQA基因exon 2遗传结构分析[J].中国科技博览,2010(2). |
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| 作者姓名： | 孔杰 解学辉 刘璐 薛慧良 徐来祥 |
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| 作者单位： | 曲阜师范大学生命科学学院,山东,曲阜,273165 |
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| 基金项目： | 科技部科研项目，国家自然科学基金，曲阜师范大学计划省级重点建设项目 |
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| 摘 要： | 本研究以山东曲阜、沂南和临朐三个地区的黑线仓鼠(Cricetulus barabensis)为材料,使用已有特异性引物,经PCR法扩增得到了该基因的外显子2全序列,并在上述群体间进行了多态性统计分析.结果表明:(1)在74个实验样本的核苷酸序列中,目的序列长度均为249b P,检测到13个变异位点,16种单倍型;(2)平均核苷酸多样性指数(Pi)较低(0.010 78),而平均单倍掣多样性指数(Hd)较高(0.757);(3)三个群体间的Kimura 2P遗传分化指数为0.016 85～0.136 48,其中曲阜和沂南地区遗传分化指数(Fst=0.136 48)的卡平方检验结果小于0.05,出现遗传分化,基因流(Nm=1.581 77)强度较弱.分子方差分析(AMOVA)得出Fst=0.058 18(P＜0.01),即5.81%的变异来自群体间,94.18%的变异来自群体内.(4)在NJ聚类树中,三个群体的单倍型并没有按照相应的地理分布区进行聚类;单倍型网络结构呈星状辐射排列.
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| 关 键 词： | 黑线仓鼠 MHC DOA 群体 遗传多态性分析 生态 |
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