| 糖苷水解酶第10家族真菌木聚糖酶保守区及进化关系的分析 |
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| 引用本文： | 龚燕燕,朱天地,殷欣,邬敏辰,吴静. 糖苷水解酶第10家族真菌木聚糖酶保守区及进化关系的分析[J]. 中国生物制品学杂志, 2014, 0(1): 46-51 |
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| 作者姓名： | 龚燕燕 朱天地 殷欣 邬敏辰 吴静 |
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| 作者单位： | 江南大学药学院;江南大学生物工程学院;江南大学无锡医学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(311012299) |
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| 摘 要： | 目的对糖苷水解酶第10家族(glucoside hydrolase family 10,GHF10)真菌木聚糖酶保守区及进化关系进行分析。方法应用CLUSTALW2软件对41条GHF10真菌木聚糖酶氨基酸序列进行多序列比对分析,获得完全保守的氨基酸位点;应用Block Maker和Consensus软件对CLUSTALW2比对结果进一步分析,确定第10家族真菌木聚糖酶共有的保守区及保守氨基酸位点;应用Pymol软件对源于GenBank中登录的6种10家族木聚糖酶进行比对,并找到这41条序列中共有的β折叠和α螺旋;利用MEGA 4.0软件对CLUSTALW2比对结果构建系统进化树,并根据进化树进行分组。结果 41条序列长度虽然不等,但均包含E270和E405两个谷氨酸催化位点。通过序列比对,得到第10家族真菌木聚糖酶的5个高度保守区TPENSMK、RGHTLVWHSQLPSWV、WDVVEN、AKLYINDYYNL、TELDI以及20个完全保守的氨基酸位点,这些保守区和保守位点多数分布在木聚糖催化区域以及(β/α)8折叠桶的内壁上。根据木聚糖酶的亲缘关系,可将第10家族真菌木聚糖酶分为3个大组,其中第1和第3组的木聚糖酶分别有12和27种,且均来源于子囊菌门;第2组仅包含2种木聚糖酶序列,来源于Neocallimastigomycota和担子菌门。结论分析了GHF10真菌木聚糖酶的保守区及进化关系,为木聚糖酶的工程改造奠定了基础。
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| 关 键 词： | 糖苷水解酶第10家族 真菌 木聚糖酶 保守区 进化 |
Conserved region of glucoside hydrolase family 10 fungal xylanases and its evolutionary relationship |
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| GONG Yan-yan;ZHU Tian-di;YIN Xin;WU Min-chen;WU Jing. Conserved region of glucoside hydrolase family 10 fungal xylanases and its evolutionary relationship[J]. Chinese Journal of Bilogicals, 2014, 0(1): 46-51 |
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| Authors: | GONG Yan-yan ZHU Tian-di YIN Xin WU Min-chen WU Jing |
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| Affiliation: | GONG Yan-yan;ZHU Tian-di;YIN Xin;WU Min-chen;WU Jing;School of Pharmaceutics,Jiangnan University; |
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