| 基于HMLP参数的二肽logP值支持向量机预测模型 |
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| 引用本文： | 印家健,李梦龙.基于HMLP参数的二肽logP值支持向量机预测模型[J].计算机与应用化学,2008,25(3). |
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| 作者姓名： | 印家健 李梦龙 |
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| 作者单位： | 1. 四川大学化学学院,四川,成都,610064;四川农业大学生命科学与理学院,四川,雅安,625014
2. 四川大学化学学院,四川,成都,610064 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金，四川农业大学生命理学院科技创新基金 |
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| 摘 要： | 肽的亲(疏)水性在生物活性肽的合理设计和药物发现中是非常重要的参数.基于表征氨基酸性质的HMLP参数,分别用直接替代法和加和替代法表征肽段的结构信息,采用留一法交叉检验,利用支持向量回归(SVR)构建了36个二肽辛醇-水分配系数(logP)的预测模型(ε=0.001,σ=7.5,C=200和ε=0.001,σ=10,C=200),结果表明加和替代法要好于直接替代法,且其留一法交叉检验的复相关系为0.8768,其预测结果与实验值一致.但二者都说明了logP主要与肽的分子表面积和亲水指标有关,同时说明HMLP参数能够较好地表征氨基酸或肽链的结构信息.
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| 关 键 词： | HMLP参数 肽 logP值 定量结构活性关系 支持向量机 |
Prediction model of 1-octanol to water partition coefficient (logP) of dipeptides based on HMLP parameters by support vector machine |
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| Yin Jiajian,Li Menglong.Prediction model of 1-octanol to water partition coefficient (logP) of dipeptides based on HMLP parameters by support vector machine[J].Computers and Applied Chemistry,2008,25(3). |
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| Authors: | Yin Jiajian Li Menglong |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | HMLP parameters peptides logP value quantitative structure-activity relationships support vector machine |
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