| 基于序列模式挖掘的基因剪接位点 |
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| 引用本文： | 孙永山,赵海峰汤振宇,李旦马猛陈荣.基于序列模式挖掘的基因剪接位点[J].数据采集与处理,2016,31(5):1010-1019. |
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| 作者姓名： | 孙永山 赵海峰汤振宇 李旦马猛陈荣 |
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| 作者单位： | 1.安徽大学计算机科
学技术学院，合肥，230601；
2.西奈山伊坎医学院遗传学与基因组学系，纽约，
10029 |
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| 摘 要： | 剪接是基因表达过程中连接转录和翻译的中枢步骤，是一个高度调控的过程。剪接位点是基因剪接过程中的核心调控元件。本文通过挖掘剪接位点序列中蕴含的序列特征，提出了一个基于序列模式挖掘的基因剪接位点序列打分模型。通过该模型，实现对剪接位点序列信号强度的定量度量。实验结果表明，该模型可有效分类真假剪接位点序列，分类效果优于最大信息熵模型，模型具有良好的鲁棒性，并且可有效识别致病剪接位
点序列突变。
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| 关 键 词： | 剪接位点 序列模式 最大信息熵模型 致病突变 |
Gene Splice Sites Based on Sequential Pattern Mining |
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| Affiliation: | 1.School of Computer Science and Technology, Anhui University, Hefei, 230601, China;
2.Department of Genetics and
Genomic Science, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, 10029, USA |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | splice sites sequential pattern maximum entropy model pathogenic mutation |
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