| 神经氨酸酶抑制剂与靶标NA分子结合模式研究 |
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| 引用本文： | 张笑,陈佩文,段红霞,韩永真,杨新玲. 神经氨酸酶抑制剂与靶标NA分子结合模式研究[J]. 计算机与应用化学, 2013, 0(7): 771-775 |
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| 作者姓名： | 张笑 陈佩文 段红霞 韩永真 杨新玲 |
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| 作者单位： | 中国农业大学理学院应用化学系，北京，100193 |
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| 基金项目： | 国家级大学生创新创业训练项目，国家‘十二五’科技支撑计划the National Scientific and Technology Supporting Program of China，中央高校基本科研业务费Chinese Universities Scientific Fund，国家自然科学基金The National Natural Science Foundation of China |
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| 摘 要： | 神经氨酸酶(NA)抑制剂作为现阶段治疗流感的主要药物,发挥着重要作用。本文运用Autodock软件,研究了3种上市的NA抑制剂一扎那米韦ZMR.、奥司他韦G39、帕拉米韦BCX与流感病毒H1N1中NA的分子间结合模式。结果指出,3种药剂与靶标NA间相互作用主要包括氢键作用、静电作用和疏水作用。其中氢键结合作用是首要识别靶标的关键因素,主要集中在NA的Site1和Site2;静电作用也主要集中在NA的Site1和Site2;而新颖的疏水作用主要表现在NA的Site4区域,由于G39、BCX中疏水烷基链取代了ZMR中甘油基,导致原有氢键作用消失,使得G39、BCX中烷基链能够自由转动与周围的关键残基形成强烈的疏水结合作用,这成为未来新型NA抑制剂设计的研究热点。期望本研究对基于流感病毒靶标结构进行新型NA抑制剂设计提供理论参考。
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| 关 键 词： | A型流感病毒 神经氨酸酶抑制剂 扎那米韦 分子对接 结合模式 |
Binding mode of neuraminidase target of H1N1 influenza virus with three inhibitors |
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| Zhang Xiao , Chen Peiwen , Duan Hongxia , Han Yongzhen , Yang Xinling. Binding mode of neuraminidase target of H1N1 influenza virus with three inhibitors[J]. Computers and Applied Chemistry, 2013, 0(7): 771-775 |
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| Authors: | Zhang Xiao Chen Peiwen Duan Hongxia Han Yongzhen Yang Xinling |
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| Affiliation: | (Department of Applied Chemistry,College of Science,China Agricultural University,Beijing 100193,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | influenza virus A neuraminidase inhibitors zanamivir molecular docking binding mode |
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