| 一种新的蛋白质结构预测多模态优化算法 |
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| 引用本文： | 程正华,张贵军,邓勇跃,金媚媚.一种新的蛋白质结构预测多模态优化算法[J].计算机科学,2013,40(9):212-215,229. |
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| 作者姓名： | 程正华 张贵军 邓勇跃 金媚媚 |
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| 作者单位： | 浙江工业大学信息工程学院 杭州310023 |
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| 基金项目： | 本文受国家自然科学基金(61075062),浙江工业大学重中之重学科开放基金(20120811)资助 |
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| 摘 要： | 针对现阶段药物设计中对于蛋白质结构多模态的需求,提出了一种基于排挤差分进化策略的多模态优化算法.为了降低蛋白质构象空间求解的复杂度,算法采用能量极小化过程,有效缩小了可行域的搜索空间；同时,为了有效地平衡多模态优化问题的局部收敛性和模态多样性,在排挤差分进化算法的框架下,在保证算法收敛速度的前提下,算法采用空间局部性原理,同时随机选取不同交叉策略的集结思想又有效改善了种群的多样性.以脑啡肽为例,算法不仅得到了其全局最稳定结构,还获得了一系列局部最优结构.
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| 关 键 词： | 差分进化算法 多模态优化 空间局部原理 集结过程 能量极小化 |
| 收稿时间： | 2012/11/16 0:00:00 |
| 修稿时间： | 5/9/2013 12:00:00 AM |
Novel Multimodal Optimization Algorithm for Protein Structure Prediction |
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| CHENG Zheng-hu,ZHANG Gui-jun,DENG Yong-yue and JIN Mei-mei.Novel Multimodal Optimization Algorithm for Protein Structure Prediction[J].Computer Science,2013,40(9):212-215,229. |
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| Authors: | CHENG Zheng-hu ZHANG Gui-jun DENG Yong-yue and JIN Mei-mei |
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| Affiliation: | College of Information Engineering,Zhejiang University of Technology,Hangzhou 310023,China;College of Information Engineering,Zhejiang University of Technology,Hangzhou 310023,China;College of Information Engineering,Zhejiang University of Technology,Hangzhou 310023,China;College of Information Engineering,Zhejiang University of Technology,Hangzhou 310023,China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Differential evolution Multimodal optimization Spatial locality Build up procedures Energy minimization |
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