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烟草TPP基因家族鉴定及表达模式分析
作者姓名:刘涛  郭存  邹宗庆  金立权  吴健  文利超  邓智超  初雨蒙  王凌涛  李伟  郭永峰
作者单位:1. 中国农业科学院烟草研究所烟草行业基因资源利用重点实验室;2. 中国农业科学院研究生院;3. 云南省烟草公司昆明市公司石林分公司;4. 福建省烟草公司龙岩市公司;5. 山东临沂烟草有限公司兰陵分公司;6. 湖北省烟草公司十堰市公司竹溪县营销部
基金项目:中国农业科学院科技创新工程(ASTIP-TRIC02);
摘    要:海藻糖-6-磷酸磷酸酶(TPP)是植物海藻糖代谢过程的关键酶,在植物的生长发育及非生物胁迫响应过程中发挥着重要的作用。为挖掘参与烟草发育及抗逆胁迫的TPP基因家族成员,本研究通过生物信息学的方法,在普通烟草基因组中共鉴定出了15个TPP基因,其中7个TPP基因定位在染色体上。系统进化分析发现,新鉴定的烟草TPP成员可分为3个亚家族,分别为CLASS Ⅰ、CLASS Ⅱ和CLASS Ⅲ。共线性分析表明,有5个烟草Nt TPP基因分别与7个拟南芥AtTPP基因形成同源基因对。启动子分析发现,NtTPP成员的启动子上存在多种激素和非生物胁迫响应元件。表达模式分析发现,NtTPP基因表达具有一定的组织特异性,大部分NtTPP基因在根中的表达量最高,有12个NtTPP基因在干旱胁迫下表达量上调,13个NtTPP基因能够被盐胁迫显著诱导表达。这说明NtTPP基因家族成员在烟草非生物胁迫应答中发挥着重要作用。

关 键 词:烟草  海藻糖-6-磷酸磷酸酶(TPP)  干旱胁迫  盐胁迫  表达模式
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