| 基于HD F5实现多区结构网格CFD程序的并行I/O |
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| 引用本文： | 杨丽鹏,车永刚. 基于HD F5实现多区结构网格CFD程序的并行I/O[J]. 计算机研究与发展, 2015, 0(4): 861-868 |
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| 作者姓名： | 杨丽鹏 车永刚 |
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| 作者单位： | 国防科学技术大学并行与分布处理国防科技重点实验室 长沙 410073 |
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| 基金项目： | 航天支撑基金项目(2012-HT-GFKD-19);空气动力学国家重点实验室基金项目(SKLA20130105) |
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| 摘 要： | 计算流体动力学（computational fluid dynamics ，CFD）是高性能计算重要应用领域之一，其计算涉及大量数据访问．在大规模并行计算情况下，串行I/O的性能与计算能力不匹配，I/O成为性能瓶颈．并行I/O 是解决这一问题的主要途径之一．针对一个真实多区结构网格CFD 并行程序 HOSTA （high‐order simulator for aerodynamics），基于HDF5（hierarchical data format v5）数据存储格式及其并行I/O编程接口，实现了其主要数据的并行I/O．在一套有6个I/O服务器结点的高性能计算机系统上，采用实际C FD算例进行了性能测试．对一个三角翼算例，并行I/O相对于串行I/O的性能加速比达到21．27，最高获得5．81 GBps的I/O吞吐率，并使程序整体性能提高10％以上；对一个网格规模更大的简单翼型算例，并行I/O最高获得了6．72 GBps的I/O吞吐率．
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| 关 键 词： | 计算流体动力学 并行I/O 层次式数据存储格式 多区结构网格 I/O吞吐率 |
HDF5 Based Parallel I/O Techniques for Multi-Zone Structured Grids CFD Applications |
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| Yang Lipeng , Che Yonggang. HDF5 Based Parallel I/O Techniques for Multi-Zone Structured Grids CFD Applications[J]. Journal of Computer Research and Development, 2015, 0(4): 861-868 |
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| Authors: | Yang Lipeng Che Yonggang |
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| Affiliation: | Yang Lipeng;Che Yonggang;Science and Technology on Parallel and Distributed Processing Laboratory,National University of Defense Technology; |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | computational fluid dynamics (CFD) parallel I/O hierarchical data format v5 (HDF5) multi-zone structured grids I/O throughput |
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