序列组装在蛋白质测序技术中的方法

从头测序技术是应用于蛋白质组学的测序方法。与其他测序技术相比,从头测序技术的优势是在不依赖数据库搜索和无需PCR扩增的基础上对DNA或者蛋白质进行测序。目前,从头测序技术也广泛应用于蛋白质组学领域。研究人员为了将测序技术所得的短序列reads进一步组装成一条完整的序列,就需要使用序列组装方法。首先,介绍了测序技术的发展背景、从头测序技术的概念以及序列组装算法的出现;其次,总结了基于Overlap-Layout-Consensus策略、de Bruijn图策略和Greedy策略的序列组装算法的具体概念和成果;最后,阐述了序列组装算法面临的挑战。