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| 暂态混沌神经网络在蛋白质关联图预测中应用研究 | |
| 引用本文： | 刘桂霞,吕晓枫,徐春艳,周春光. 暂态混沌神经网络在蛋白质关联图预测中应用研究[J]. 小型微型计算机系统, 2008, 29(7) |
| 作者姓名： | 刘桂霞 吕晓枫 徐春艳 周春光 |
| 作者单位： | 1. 吉林大学,计算机科学与技术学院,吉林,长春,130012 2. 吉林大学,计算中心,吉林,长春,130012 3. 北华大学,计算机科学与技术学院,吉林,吉林,132021 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金 , 国家自然科学基金 |
| 摘 要： | 蛋白质结构预测是生物信息学的一个主要研究方向,而蛋白质关联图预测是其中的一个重要内容.针对蛋白质关联图预测问题,提出一种暂态混沌神经网络实现方法,所提出的方法具有暂态混沌特性和平稳收敛特性,能有效避免传统Hopfield 神经网络极易陷入局部极值的缺陷.它通过短暂的倒分叉过程,能很快进入稳定收敛状态.仿真结果表明:暂态混沌神经网络解决蛋白质关联图预测问题时,总能收敛到全局最优或几乎接近全局最优,同时具有更高的搜索效率.这种方法预测精度达到0.27,比随机预测器高9倍. |
| 关 键 词： | 蛋白质关联图 人工神经网络 暂态混沌神经网络 疏水性 二级结构 暂态混沌神经网络 蛋白质 关联图 预测器 应用 研究 Maps Contact Protein Prediction Chaotic Neural Network Application 随机 预测精度 搜索效率 全局最优 稳定收敛 仿真结果 状态 倒分叉过程 |
Research on Application of Transiently Chaotic Neural Network in Prediction of Protein Contact Maps |
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| LIU Gui-xia,LV Xiao-feng,XU Chun-yan,ZHOU Chun-guang. Research on Application of Transiently Chaotic Neural Network in Prediction of Protein Contact Maps[J]. Mini-micro Systems, 2008, 29(7) | |
| Authors: | LIU Gui-xia LV Xiao-feng XU Chun-yan ZHOU Chun-guang |
| Affiliation: | LIU Gui-xia1,LV Xiao-feng2,XU Chun-yan3,ZHOU Chun-guang11(Jilin University College of Computer Science , Technology,Changchun 130012,China)2(Jilin University Computational Center,China)3(Beihua University College of Computer Science , Technology,Jilin 132021,China) |
| Abstract: | The protein structure prediction is a main direction in bioinformatics,and the prediction of protein contact maps is an important content in protein structure prediction.A algorithm based on transiently chaotic neural network is proposed to solve the protein contact maps problem.The proposed neural networks have many merits which are transient chaos and stable convergence etc.so as to overcome the drawbacks of easily getting stuck in local minim in conventional Hopfield neural networks.It can reach a stable... |
| Keywords: | prediction of protein contact maps artificial neural network transiently chaotic neural network hydrophobicity secondary structure |
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