蛋白质折叠计算机模拟研究进展 |
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引用本文: | 魏彦杰,张慧玲,黄庆生.蛋白质折叠计算机模拟研究进展[J].集成技术,2014,3(4):58-66. |
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作者姓名: | 魏彦杰 张慧玲 黄庆生 |
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作者单位: | 中国科学院深圳先进技术研究院高性能计算技术研究中心深圳市高性能数据挖掘重点实验室; |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(11204342);深圳市科创委项(JCYJ20120615140912201);深圳市孔雀计划项目(KQCX20130628112914299) |
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摘 要: | 蛋白质折叠过程中的结构变异可能导致"折叠病",比如老年痴呆症和多聚谷氨酰胺疾病等。因此蛋白质折叠研究对于揭示"折叠病"致病机理、指导药物设计等具有重大意义。文章阐述了蛋白质折叠计算机模拟研究的研究近况,分别介绍了蛋白质侧链研究、蛋白质折叠算法、蛋白质折叠病研究、蛋白质的分子动力学模拟和蛋白质结构预测等几个方面。
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关 键 词: | 蛋白质折叠 并行蒙特卡洛算法 蛋白质结构预测 分子动力学模拟 蛋白质折叠病 |
Advances on Computer Simulations of Protein Folding |
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Authors: | WEI Yanjie ZHANG Huiling and HUANG Qingsheng |
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Abstract: | Protein misfolding leads to many diseases, such as Alzhemizer disease and polyQ diseases, etc. Protein folding
is vital for the mechanism study of folding-related diseases. In this paper, several aspects in protein folding were reviewed,
including the side chain ordering, computational algorithms for protein folding, folding diseases, molecular dynamics
simulation and structure prediction. |
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Keywords: | protein folding parallel monte carlo method protein structure prediction molecular dynamics simulation protein folding disease |
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