| 基于遗传算法的黄酮类化合物对PTKs抑制性的QSAR研究 |
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| 引用本文： | 张运陶,范磊,程正军.基于遗传算法的黄酮类化合物对PTKs抑制性的QSAR研究[J].计算机与应用化学,2007,24(12):1681-1686. |
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| 作者姓名： | 张运陶 范磊 程正军 |
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| 作者单位： | 西华师范大学应用化学研究所,四川,南充,637002 |
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| 摘 要： | 用文献设定的结构参数和本文设定的结构参数,分别与由HyperChem7.5Student Evaluation计算得到的量化参数作为自变量构成2组数据,以逐步回归,遗传算法-偏最小二乘法(GA-PLS)和遗传算法-支持向量机(GA-SVM)等算法就黄酮类化合物对PTKs抑制性进行QSAR研究。用各算法模型处理数据,由本文设定的结构参数构成的数据集获得的预测结果更好,表明采用取代基团类型和取代位置结合的编码参数包含的信息更为丰富,对物质性质的描述更加合理。在各种算法中, GA-SVM模型均具有最佳预测效果,该算法对2组数据作留一法预测处理得到的相关系数R和PTKs抑制性实验值与预测值的平均绝对误差MAE分别为0.7595,0.2871和0.7864,0.2883。研究还表明,GA-PLS和GA-SVM联用算法的预测效果远高于单独使用的PLS和SVM算法;由逐步回归建立的MLR模型对2组数据进行计算处理,尽管拟合时相关系数R分别达到0.8136和0.8250,但作留一法交互验证时却下降到0.7113和0.7354,明显低于GA-PLS和GA-SVM联用算法。
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| 关 键 词： | 支持向量机 遗传算法 黄酮类化合物 PTKs抑制性 QSAR |
| 文章编号： | 1001-4160(2007)12-1681-1686 |
| 修稿时间： | 2007年10月8日 |
QSAR study of fiavonoids derivatives as p56lck protein tyrosine kinase inhibitors using GA-SVM |
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| Zhang Yuntao,Fan Lei,Cheng Zhengjun.QSAR study of fiavonoids derivatives as p56lck protein tyrosine kinase inhibitors using GA-SVM[J].Computers and Applied Chemistry,2007,24(12):1681-1686. |
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| Authors: | Zhang Yuntao Fan Lei Cheng Zhengjun |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | support vector machine genetic algorithm flavonoids protein tyrosine kinases QSAR |
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