| 坛紫菜5.8S rDNA和ITS区片段的序列分析及应用 |
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| 引用本文： | 谢潮添,纪德华,陈昌生,徐燕,刘冰. 坛紫菜5.8S rDNA和ITS区片段的序列分析及应用[J]. 高技术通讯, 2007, 17(5): 540-545 |
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| 作者姓名： | 谢潮添 纪德华 陈昌生 徐燕 刘冰 |
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| 作者单位： | 集美大学水产学院,厦门,361021 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划(863计划) , 国家自然科学基金 , 福建省科技攻关项目 , 福建省出入境检验检疫局资助项目 |
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| 摘 要： | 对坛紫菜(Porphyra haitanensis)野生(GL)和栽培(PXV)品系的5.8S rDNA-ITS兀区进行了PCR扩增和序列分析,扩增的GL和PXV的DNA片段长度分别为1213 bp和1221bp,包含完整的ITS1-5.8S-ITS2区.然后对紫菜7个种9个品系(其中6种7个品系从GenBank数据库中获得)的rDNA相应序列进行了排序和系统进化分析,结果表明:9个紫菜品系rDNA中5.8S区的长度和序列非常保守,而ITS区的长度和序列则变异较大;根据它们的序列差异,计算出这9个紫菜品系的遗传距离在0.010～0.551之间,遗传相似性在44.9%～99%之间;并且采用邻接法构建了这9个紫菜品系的系统发育树,发现可以明显分为4个进化枝,由此讨论了分子分类方法同传统分类方法的分歧.实验结果表明,5.8S rDNA.ITS区序列可以成为紫菜种质鉴定和系统进化研究的强有力工具.
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| 关 键 词： | 坛紫菜 rDNA ITS 序列分析 |
| 收稿时间： | 2006-06-30 |
| 修稿时间： | 2006-06-30 |
Sequence analysis and application of 5.8S rDNA and ITS regions of porphyra haitanensis |
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| Xie Chaotian,Ji Dehua,Chen Changsheng,Xu Yan,Liu Bing. Sequence analysis and application of 5.8S rDNA and ITS regions of porphyra haitanensis[J]. High Technology Letters, 2007, 17(5): 540-545 |
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| Authors: | Xie Chaotian Ji Dehua Chen Changsheng Xu Yan Liu Bing |
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| Affiliation: | College of Fisheries, Jimei University, Xiamen 361021 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Porphyra haitanensis rDNA ITS sequence analysis |
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