| RPLC—SDS—PAGE整体蛋白质分离与纳升毛细管液相色谱-串联质谱联用技术的研究及应用 |
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| 作者姓名： | 张养军 李文瑞 孟庆芳 邓新宇 田英华 王京兰 杨兵 蔡耘 朱云平 贺福初 钱小红 |
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| 作者单位： | 军事医学科学院放射医学研究所基因组与蛋白质组研究室,北京,100850 |
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| 基金项目： | 该研究获得国家科技攻关计划项目(2002-BA711A11),国家重点基础研究发展规划项目(2001CB510201),北京市科研基金项目(H030230280190)和国家自然科学基金(20275046,20275044,30321003)的资助. |
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| 摘 要： | 采用RPLC-SDS-PAGE与纳升毛细管液相色谱-串联质谱联用技术对国际人类蛋白质组织(HUPO)提供的法国人肝脏蛋白质组表达谱的构建及其理化性质的统计分析,鉴定了2552条肽段,归结于402种蛋白质和240个蛋白质簇.蛋白质的pI分布范围为4.29～11.57,分子量范围为8,593～3,816,218Da,其中大于100kDa的蛋白质占到所鉴定蛋白质的10%,二者皆高于两维凝胶电泳的等电点和分子量范围(一般等电点3～10;分子量10～100kDa).另外,蛋白质组中不同蛋白质的疏水性分布显示大部分蛋白质为可溶性蛋白质,其中疏水性蛋白质占15%(GRAVY＞0的蛋白质).实验结果表明该技术路线兼顾了反相色谱分离度高和SAS-PAGE兼容性好的优点,可用于复杂组织或细胞中蛋白质组表达谱的构建或比较蛋白质组的研究,为蛋白质组学的方法学研究奠定了基础.
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| 关 键 词： | 蛋白质组学 反相液相色谱 SDS-PAGE 液-质联用 |
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