| 基于传统分离培养和高通量测序分析市售咸鳓鱼中微生物多样性 |
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| 引用本文： | 毛海萍,袁开,金仁耀,冯俊丽,戴志远,吴佳佳.基于传统分离培养和高通量测序分析市售咸鳓鱼中微生物多样性[J].食品研究与开发,2019,40(21):193-201. |
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| 作者姓名： | 毛海萍 袁开 金仁耀 冯俊丽 戴志远 吴佳佳 |
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| 作者单位： | 1.浙江工商大学海洋食品研究院，浙江杭州310012；2.中国计量大学生命科学学院，浙江杭州310018；3.浙江省水产品加工技术研究联合重点实验室，浙江杭州310012 |
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| 摘 要： | 以6种浙东地区市售咸鳓鱼为对象,采用分离培养的方法结合16S rDNA V4可变区高通量测序较为全面地探究其中微生物多样性,并且分析分离菌株氨基酸脱羧酶基因及常见抗生素耐药基因携带情况。试验共分离获得151株可培养细菌,16S rDNA测序将其鉴定至14个属和23个种,其中芽孢杆菌数量最多(98株,64.90%);葡萄球菌其次(20株,13.25%);嗜冷杆菌次之(13株,8.61%)。132株分离菌株携带组氨酸脱羧酶基因,占比高达87.42%;鸟氨酸脱羧酶基因和赖氨酸脱羧酶基因的携带比例分别为46.36%和45.03%。耐药基因携带率处于较低水平。高通量测序研究结果表明,门水平上,厚壁菌门(Firmicutes)是市售咸鳓鱼中主要优势微生物。碱杆菌属(Alkalibacillus)、慢性芽孢杆菌属(Lentibacilus)、狭义梭菌属(Clostridium sensu stricto)、梭菌属(Clostridiaceae)等分别在不同样品中占据较高比例,不同来源样品中微生物多样性呈现出较大的差异。
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| 关 键 词： | 咸鳓鱼 微生物 多样性 分离培养 高通量测序 |
| 收稿时间： | 2018/12/4 0:00:00 |
Study of Microbial Diversity in Commercial Salted Chinese Herring Using Culture Isolation and High-throughput Sequencing |
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| MAO Hai-ping,YUAN Kai,JIN Ren-yao,FENG Jun-li,DAI Zhi-yuan,WU Jia-jia.Study of Microbial Diversity in Commercial Salted Chinese Herring Using Culture Isolation and High-throughput Sequencing[J].Food Research and Developent,2019,40(21):193-201. |
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| Authors: | MAO Hai-ping YUAN Kai JIN Ren-yao FENG Jun-li DAI Zhi-yuan WU Jia-jia |
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