| 水稻基因组MSAP指纹图谱构建及DNA甲基化修饰位点分离与鉴定 |
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| 引用本文： | 张勇,邓科君,张韬,杨足君,彭金华,周建平,任正隆. 水稻基因组MSAP指纹图谱构建及DNA甲基化修饰位点分离与鉴定[J]. 高技术通讯, 2009, 19(9). DOI: 10.3772/j.issn.1002-0470.2009.09.018 |
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| 作者姓名： | 张勇 邓科君 张韬 杨足君 彭金华 周建平 任正隆 |
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| 作者单位： | 1. 电子科技大学生命科学与技术学院,成都,610054;四川农业大学植物遗传育种省级重点实验室,雅安,625014
2. 电子科技大学生命科学与技术学院,成都,610054 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金，国家博士后科学基金，电子科技大学青年基金 |
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| 摘 要： | 采用EcoR I和Hpa II/Msp I双酶切建立了适合于水稻基因组的甲基化敏感扩增多态性(MSAP)分析体系,在全基因组水平检测了水稻DNA甲基化修饰位点.以12对MSAP引物进行选择性扩增,共检测到甲基化修饰位点120个,"CCGG/GGCC"位点甲基化修饰比例为20.17%.对部分水稻基因组甲基化修饰位点进行回收,最终分离了55条存在甲基化位点变异的DNA序列,通过BLAST比对分析将其联配到水稻基因组序列上.分析表明,这些甲基化修饰位点主要集中于基因启动子区(47%)和第一外显子区(22%),在其侧翼序列中存在类似"CpG island" 典型序列特征的"CpG"二核苷酸成簇富集区.在此基础上,对应用MSAP技术分离水稻基因组DNA甲基化修饰位点的有效性以及水稻基因组序列中"CpG island"类似序列分布特征和生物意义进行了讨论.
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| 关 键 词： | 水稻 表观遗传 DNA甲基化 甲基化敏感扩增多态性(MSAP) CpG岛 |
Construction of rice genomic methylation-sensitive amplification polymorphism fingerprint and characterization of DNA methylated sites |
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| Zhang Yong,Deng Kejun,Zhang Tao,Yang Zujun,Peng Jinhua,Zhou Jianping,Ren Zhenglong. Construction of rice genomic methylation-sensitive amplification polymorphism fingerprint and characterization of DNA methylated sites[J]. High Technology Letters, 2009, 19(9). DOI: 10.3772/j.issn.1002-0470.2009.09.018 |
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| Authors: | Zhang Yong Deng Kejun Zhang Tao Yang Zujun Peng Jinhua Zhou Jianping Ren Zhenglong |
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| Affiliation: | Zhang Yong~(* **) Deng Kejun~* Zhang Tao~* Yang Zujun~* Peng Jinhua~* Zhou Jianping~* Ren Zhenglong~(* **)(* School of Life Sciences and Technology,University of Electronic Science and Technology of China,Chengdu 610054)(* ** Sichuan Provincial Key Laboratory of Plant Breeding and Genetics,Sichuan Agriculture University,Ya'an 625014) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Oryza sativa epigenetic DNA methylation methylation-sensitive amplification polymorphism(MSAP) CpG island |
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