| 高通量测序数据分析现状与挑战 |
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| 引用本文： | 张文力. 高通量测序数据分析现状与挑战[J]. 集成技术, 2012, 1(3): 20-24 |
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| 作者姓名： | 张文力 |
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| 作者单位： | 中国科学院计算技术研究所;计算机体系结构国家重点实验室 |
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| 摘 要： | 基因是遗传的物质基础。生物体的生、长、病、老、死等一切生命现象都与基因有关。基因测序是解读生命的一种途径。随着新一代高通量测序技术的发展,每天会产生TB甚至更多的序列数据。合理诠释这些大规模及复杂高维度的数据成为获取数据后一个更大的难点,是当前生物研究的关键步骤,具有巨大的现实意义。海量高通量测序数据的存储、处理和分析都极大地挑战着当前的计算机系统和计算模式。本文将结合调研情况,尤其是华大基因的实例调研,讨论当前高通量测序数据分析的现状、问题和多方采取的措施。然而,面对高通量测序数据带来的挑战,仍需要多方密切合作和长久深入的研究。
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| 关 键 词： | 基因组 高通量测序 数据分析 云计算 工作流 |
Status and Challenges on Data Analysis of High Throughput Sequencing |
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| ZHANG Wen-li. Status and Challenges on Data Analysis of High Throughput Sequencing[J]. , 2012, 1(3): 20-24 |
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| Authors: | ZHANG Wen-li |
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| Affiliation: | ZHANG Wen-li 1,2 1(Institute of Computing Technology,Chinese Academy of Sciences,Beijing 100190,China) 2(State Key Laboratory of Computer Architecture,Beijing 100190,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | genome high throughput sequencing data analysis cloud computing work flow |
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