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基于串行FastLSA的并行算法
引用本文:陈鹏飞,王长山. 基于串行FastLSA的并行算法[J]. 计算机工程, 2004, 30(19): 65-67
作者姓名:陈鹏飞  王长山
作者单位:西安电子科技大学计算机学院,西安,710071;西安电子科技大学计算机学院,西安,710071
摘    要:提出了一种基于串行Fast LSA算法的两个序列比对的并行算法。主要是对海量级的序列比对,目的是减少串行Fast LSA算法的时间和空间的复杂度。实验结果表明该算法完全可以并行化,而且空间复杂度降到线性空间。

关 键 词:并行和串行算法  序列比对  线性空间
文章编号:1000-3428(2004)19-0065-03

Parallelism Algorithm Based on Sequential FastLSA
CHEN Pengfei,WANG Changshan. Parallelism Algorithm Based on Sequential FastLSA[J]. Computer Engineering, 2004, 30(19): 65-67
Authors:CHEN Pengfei  WANG Changshan
Abstract:
Keywords:Parallel and sequential algorithm  Sequence alignment  Linear space
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