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乙酰胆碱受体δ、r亚基上Loop F高可靠性结构模型的构建
引用本文:孟庆雄,王婉瑜,熊郁良.乙酰胆碱受体δ、r亚基上Loop F高可靠性结构模型的构建[J].昆明理工大学学报(理工版),2004,29(4):185-189.
作者姓名:孟庆雄  王婉瑜  熊郁良
作者单位:中科院昆明动物研究所动物毒素研究室,云南昆明650223
基金项目:国家自然科学基金资助(项目编号:39670165).
摘    要:报导从单斑眼镜蛇(monocellete cobra,Naja kaouthia)毒中分离纯化出一个新的短链神经毒cobrotoxin c(CBT C),并确定了一个新的功能氨基酸Arg56.根据笔者测定的NMR液相三级结构和近年来神经毒素与受体结合机制研究的进展,推断Arg56及公认的功能残基Lys27、Lys47一起与α1型乙酰胆碱受体δ/r亚基上的Loop F相互作用.基于此,笔者以MODEILER 6V2软件构建了这种蛇毒的包括CBT C在内的五个短链神经毒与Loop F结合的模型.五个模型中的Loop F结构具有高度的一致性,RMSD值在0.22nm左右,从而断定此模型有较高的可靠性.构建出的Loop F的结构模型将对构建高可靠性α1型AChR结构模型、研究离子通道开闭机制等都具非常重要的意义.

关 键 词:短链神经毒  乙酰胆碱受体  Loop  F  柔性分子对接
文章编号:1007-855X(2004)04-0185-05
修稿时间:2004年5月6日
本文献已被 CNKI 维普 等数据库收录!
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