基于MPI和CUDA的蛋白质定量软件的设计和分析 |
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引用本文: | 詹 科,王 靖,袁 良,张云泉. 基于MPI和CUDA的蛋白质定量软件的设计和分析[J]. 计算机科学, 2013, 40(3): 36-37 |
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作者姓名: | 詹 科 王 靖 袁 良 张云泉 |
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作者单位: | (中国科学院软件研究所并行软件与计算科学实验室 北京100190);(中国科学院研究生院 北京100049) |
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摘 要: | 介绍了蛋白质定量软件的设计及测试结果,分析结果表明:P-QuantWiz软件在曙光600。的Intel集群部分,测试规模达到2048核,在256核加速比仍在增加。相对P-QuantWiz软件在单CPU运行的结果,PG-QuantWiz软件在单CPU运行的加速比为8.1,在16个GPU上运行的加速比为14.18,并行效率为89%。
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关 键 词: | MPI CUDA,蛋白质定量 |
Design and Analysis of Protein Quantification Software Based on MPI and CUDA |
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Abstract: | |
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Keywords: | MPI CUDA Protein ctuantification |
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