| 基于自相关函数的蛋白质-蛋白质作用位点预测研究 |
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| 引用本文： | 陈伟,程咏梅,杨会芳,张绍武.基于自相关函数的蛋白质-蛋白质作用位点预测研究[J].计算机与应用化学,2010,27(6). |
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| 作者姓名： | 陈伟 程咏梅 杨会芳 张绍武 |
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| 作者单位： | 西北工业大学自动化学院,陕西,西安,710072 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目，西北工业大学科技创新项目 |
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| 摘 要： | 蛋白质-蛋白质相互在细胞生命过程扮演重要角色,广泛参与免疫反应,信号传导,基因表达,蛋白质合成等,研究蛋白质-蛋白质作用位点,将有助于揭示生命过程的许多本质,对预防、诊断疾病,以及突变设计、蛋白质相互作用网络构建等方面均具有重要的参考价值.根据蛋白质.蛋白质作用位点残摹倾向性及作用位点与其周围临近残基密切相关的特性,本文提出基于序列谱(或空间谱)构建自相关函数,度量邻近残基之间的相关程度,采用AdaB00st分类器预测蛋白质-蛋白质相互作用位点,精度达到67.6%,表明本文的方法预测蛋白质-蛋白质相互作用位点是有效的,为研究蛋白质-蛋白质相互作用位点研究提供了一种新方法.
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| 关 键 词： | 自相关函数 序列谱 空间谱 蛋白质-蛋白质作用位点 |
Predicting protein-protein interaction site based on auto-correlation function |
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| Chen Wei,Cheng Yongmei,Yang Huifang,Zhang Shaowu.Predicting protein-protein interaction site based on auto-correlation function[J].Computers and Applied Chemistry,2010,27(6). |
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| Authors: | Chen Wei Cheng Yongmei Yang Huifang Zhang Shaowu |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | AdaBoost |
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