| 人类p53肿瘤蛋白的偏好性分析及其应用* |
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| 引用本文： | 孔娟娟,朱平. 人类p53肿瘤蛋白的偏好性分析及其应用*[J]. 计算机应用研究, 2011, 28(8): 2987-2990. DOI: 10.3969/j.issn.1001-3695.2011.08.051 |
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| 作者姓名： | 孔娟娟 朱平 |
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| 作者单位： | 江南大学理学院,江苏无锡,214122 |
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| 基金项目： | 江南大学创新团队发展计划资助项目（PIRTJiangnan2008CXTD02） |
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| 摘 要： | 为了深入研究人类p53肿瘤蛋白，对七条最新的人类p53肿瘤蛋白的mRNA序列的偏好性及其同源性进行了分析。利用MEGA4.0（molecular evolutionary genetics analysis）软件的Distance功能得到七条基因的mRNA序列及其相应的蛋白质序列的同源性，并通过比较它们的RSCU和QRSCU值，对p53基因发生突变时偏好使用同义密码子的情况进行了分析。研究结果表明，基于拟氨基酸编码方法能更明显地展示出它们对同义密码子的一致偏好性，并且p53基因发生突变时偏好使用以c/g结
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| 关 键 词： | p53肿瘤蛋白； mRNA序列； 偏好性； 同源性； 同义密码子； 同义密码子相对使用度； QRSCU |
Research and application of codon bias of human p53 tumor protein |
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| KONG Juan-juan,ZHU Ping. Research and application of codon bias of human p53 tumor protein[J]. Application Research of Computers, 2011, 28(8): 2987-2990. DOI: 10.3969/j.issn.1001-3695.2011.08.051 |
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| Authors: | KONG Juan-juan ZHU Ping |
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| Affiliation: | (School of Science, Jiangnan University, Wuxi Jiangsu 214122, China) |
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| Abstract: | In order to study human p53 tumor protein further,this paper selected seven latest human p53 tumor protein mRNA sequences from GenBank,and analyzed their codon bias.It obtained the homology of the seven mRNA sequences by using MEGA4.0 software.By analyzing and comparing their RSCU and QRSCU,analyzed the conditions of p53 mutated genes preference.The result shows that the method based on the classification of Quasi-amino acid showed its synonymous codon consistent bias more obviously,and p53 mutated genes pr... |
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| Keywords: | p53 tumor protein mRNA sequence bias homology synonymous codon RSCU QRSCU |
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