| 普通烟草GATA转录因子家族鉴定及基因表达分析 |
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| 引用本文： | 杨玄松,谢雯榕,顾钢,宋江雨,赵云飞,林晓路,谢小芳,张炳辉. 普通烟草GATA转录因子家族鉴定及基因表达分析[J]. 烟草科技, 2023, 56(1): 11-23. DOI: 10.16135/j.issn1002-0861.2022.0109 |
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| 作者姓名： | 杨玄松 谢雯榕 顾钢 宋江雨 赵云飞 林晓路 谢小芳 张炳辉 |
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| 作者单位： | 1.福建农林大学生命科学学院, 福州市仓山区上下店路15号 3500022.福建省烟草专卖局烟草科学研究所，福州市鼓楼区北环中路133号 3500033.福建省烟草公司南平市公司，福建省南平市延平区江滨中路389号 3642004.福建省烟草公司三明市公司，福建省三明市三元区崇桂新村100幢 3650005.福建省烟草公司龙岩市公司，福建省龙岩市新罗区龙岩大道288号 364000 |
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| 基金项目： | 中国烟草总公司福建省公司科技计划项目“鲜烟成熟度智能化检测技术研究”2019350000240137 |
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| 摘 要： | GATA转录因子在调控植物的生长发育和逆境胁迫应答等过程中具有重要作用。为了明确烟草中GATA基因的结构与功能，基于同源搜索和结构域鉴定的方法从普通烟草基因组中鉴定出57个GATA基因家族成员，分别命名为NtGATA1~NtGATA57。基因结构、保守结构域和系统进化的生物信息学分析表明:烟草GATA基因家族成员可分为4个亚族，且同一亚族成员核心结构域氨基酸序列组成非常保守，各基因成员的外显子数目在1~17之间。转录组数据分析表明:大多数NtGATA基因在烟叶衰老的不同时期均有表达，而且不同家族成员的表达模式存在差异；实时荧光定量PCR分析发现:10个NtGATA基因对冷、盐和干旱等非生物胁迫存在不同程度的响应。说明烟草GATA基因家族成员在烟叶成熟衰老及逆境响应过程中可能发挥了重要作用。
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| 关 键 词： | 烟草 GATA基因家族 生物信息学 基因表达 逆境胁迫 |
| 收稿时间： | 2022-02-25 |
Identification and gene expression analysis of GATA transcription factor family in Nicotiana tabacum |
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| YANG Xuansong,XIE Wenrong,GU Gang,SONG Jiangyu,ZHAO Yunfei,LIN Xiaolu,XIE Xiaofang,ZHANG Binghui. Identification and gene expression analysis of GATA transcription factor family in Nicotiana tabacum[J]. Tobacco Science & Technology, 2023, 56(1): 11-23. DOI: 10.16135/j.issn1002-0861.2022.0109 |
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| Authors: | YANG Xuansong XIE Wenrong GU Gang SONG Jiangyu ZHAO Yunfei LIN Xiaolu XIE Xiaofang ZHANG Binghui |
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| Affiliation: | 1.College of Life Sciences, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002, China2.Tobacco Science Research Institute of Fujian Tobacco Monopoly Bureau, Fuzhou 350003, China3.Nanping Branch of Fujian Provincial Tobacco Company, Nanping 364200, Fujian, China4.Sanming Branch of Fujian Provincial Tobacco Company, Sanming 365000, Fujian, China5.Longyan Branch of Fujian Provincial Tobacco Company, Longyan 364000, Fujian, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | |
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