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芽孢杆菌植酸酶基因的克隆及生物信息学分析
引用本文:许伟,仇明,余晓红,封功能,邵荣.芽孢杆菌植酸酶基因的克隆及生物信息学分析[J].食品科学,2011,32(7):202-206.
作者姓名:许伟  仇明  余晓红  封功能  邵荣
作者单位:盐城工学院化学与生物工程学院
基金项目:江苏省普通高校自然科学研究资助项目(09KJB530011)
摘    要:采用PCR技术从Bacillus amyloliquefaciens DSM 1061中克隆到植酸酶的全长基因phyC(1152bp),并将该基因成功克隆到表达载体pET22b(+),经PCR鉴定和DNA测序证明,pET22b(+)-phyC重组质粒构建成功。将该酶的氨基酸序列在Swiss-prot数据中进行BLAST比对发现,该序列未见报道,其与来自Bacillus subtilis的植酸酶序列(Swiss-prot ID: O31097)最相似,序列一致性为98.7%。分析可知该氨基酸序列在位点为128、144、153、257和370处分别变异为Ala、Ile、Ser、Pro和Lys。运用SignalP 3.0服务器对其信号肽进行预测,表明该酶N端1~26个残基可能是信号肽序列。运用SWISS-MODEL服务器进行同源建模,经PROCHECK V3.5软件对其Ramachandran plot、G-factor等进行评价,结果显示结构模型中的键长、键角及二面角的分布及结构合理。该基因已在GenBank上登录(登录号为HM747163)。

关 键 词:同源建模  植酸酶基因  克隆  
收稿时间:2010-08-06

Gene Cloning and Bioinformatics Analysis of Phytase from Bacillus amyloliquefaciens
XU Wei,QIU Ming,YU Xiao-hong,FENG Gong-neng,SHAO Rong.Gene Cloning and Bioinformatics Analysis of Phytase from Bacillus amyloliquefaciens[J].Food Science,2011,32(7):202-206.
Authors:XU Wei  QIU Ming  YU Xiao-hong  FENG Gong-neng  SHAO Rong
Affiliation:College of Chemical and Biological Engineering,Yancheng Institute of Technology,Yancheng 224051,China
Abstract:The full-length DNA sequence of neutral phytase gene was cloned from Bacillus amyloliquefaciens DSM 1061 by PCR,and successfully inserted into the expression vector pET22b(+).The results were identified by PCR and DNA sequencing.Based on Blast alignment,it was found that the amino acid sequence of the enzyme has never been reported the Swiss-prot database.Its amino acids sequence showed 98.7% identity with that of Bacillus subtilis(Swiss-prot ID:O31097).The residues 128,144,153,257 and 370 are replaced by A...
Keywords:phytase gene  cloning  homology modeling  
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