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烟草PVYN辽宁分离物全序列测定与分析
引用本文:王芳,高正良,周本国,许大凤,安梦楠,吴元华.烟草PVYN辽宁分离物全序列测定与分析[J].中国烟草学报,2013(4).
作者姓名:王芳  高正良  周本国  许大凤  安梦楠  吴元华
作者单位:1. 沈阳农业大学,植物保护学院,沈阳市东陵路120号 110161; 安徽省农业科学院,烟草所,合肥市农科南路40号 230031
2. 安徽省农业科学院,烟草所,合肥市农科南路40号 230031
3. 沈阳农业大学,植物保护学院,沈阳市东陵路120号 110161
基金项目:辽宁省烟草公司科技攻关项目(辽烟计,安徽省烟草公司科技攻关项目
摘    要:利用引起烟草脉坏死病的马铃薯Y病毒脉坏死株系辽宁分离物(Potato virus Y-vein necrosis strain Liaoning isolate, PVYN-LN),以GenBank中已有的PVY全序列为基础,设计特异引物。通过总RNA提取、RT-PCR、3’RACE和5’RACE扩增及序列测定,测得PVYN-LN全长基因组序列(NCBI登录号为JQ971975)包括9714个碱基(含PolyA尾),整条序列仅包含一个由9186个碱基组成的开放读码框(ORF),编码一条包含3061个氨基酸的多聚蛋白。对所得序列进行BLAST,利用MEGA软件对所测得的PVYN-LN全序列与GenBank中已有的PVY全序列及氨基酸进行系统进化分析,发现PVYN-LN分离物与已报道的PVYN株系具有较高的进化亲缘关系,该分离物属于PVYN株系。序列重组分析软件RDP4分析,该序列无重组。

关 键 词:烟草  PVYN-LN  基因组全序列  重组分析

Sequencing and analysis of tobacco PVYN Liaoning isolate
WANG Fang , GAO Zhengliang , ZHOU Benguo , XU Dafeng , AN Mengnan , WU Yuanhua.Sequencing and analysis of tobacco PVYN Liaoning isolate[J].Acta Tabacaria Sinica,2013(4).
Authors:WANG Fang  GAO Zhengliang  ZHOU Benguo  XU Dafeng  AN Mengnan  WU Yuanhua
Abstract:
Keywords:tobacco  potato virus Y  genome sequence  recombination analysis
本文献已被 万方数据 等数据库收录!
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