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AAindex数据库中傅里叶方法的多重氨基酸指数选择
引用本文:赵剑,许金涛. AAindex数据库中傅里叶方法的多重氨基酸指数选择[J]. 数据采集与处理, 2013, 28(5): 643-649
作者姓名:赵剑  许金涛
作者单位:1. 南京工业大学理学院,南京,210009;南京工业大学生物与制药工程学院,南京,210009
2. 南京工业大学理学院,南京,210009
基金项目:南京工业大学青年教师基金
摘    要:波谱学方法研究蛋白质时,蛋白质序列的特征频率与蛋白质的位点、功能、空间结构对应.基于时间序列傅里叶变换的交叉谱原理,本文提出的“一个蛋白质关于多种氨基酸指数的一致谱”能够获取一个或多个蛋白质序列较显著的特征频率,再由特征频率去筛选与之对应的氨基酸指数.该方法与Lazovi(c)的筛选方法和筛选意义不同.结果显示,筛选出的氨基酸指数对应的性质多数与蛋白质的空间结构性质有关.蛋白质特征频率也许是用于特征提取的好方法,氨基酸指数筛选可被看作蛋白质数字表达的一种优化.

关 键 词:氨基酸指数数据库  傅里叶变换  特征频率  氨基酸指数筛选  信噪比

Selection of Multi Amino Acid Indices Based on Fourier Transform Analysis in AAindex Database
Zhao Jian , Xu Jintao. Selection of Multi Amino Acid Indices Based on Fourier Transform Analysis in AAindex Database[J]. Journal of Data Acquisition & Processing, 2013, 28(5): 643-649
Authors:Zhao Jian    Xu Jintao
Abstract:
Keywords:amino acid index database  Fourier transform  characteristic frequency  selection of amino acid indices  signal to noise ratio
本文献已被 万方数据 等数据库收录!
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