| 副溶血性弧菌16S rRNA基因序列变异规律分析 |
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| 引用本文： | 冯博,蓝英,孙晓红,张炜佳,潘迎捷,赵勇. 副溶血性弧菌16S rRNA基因序列变异规律分析[J]. 食品与生物技术学报, 2016, 35(9): 928-934 |
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| 作者姓名： | 冯博 蓝英 孙晓红 张炜佳 潘迎捷 赵勇 |
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| 作者单位： | 上海海洋大学 食品学院，上海 201306; 上海水产品加工贮藏工程技术研究中心，上海 201306; 农业部水产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室(上海)，上海 201306,上海海洋大学 食品学院，上海 201306; 上海水产品加工贮藏工程技术研究中心，上海 201306; 农业部水产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室(上海)，上海 201306,上海海洋大学 食品学院，上海 201306; 上海水产品加工贮藏工程技术研究中心，上海 201306; 农业部水产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室(上海)，上海 201306,上海海洋大学 食品学院，上海 201306; 上海水产品加工贮藏工程技术研究中心，上海 201306; 农业部水产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室(上海)，上海 201306,上海海洋大学 食品学院，上海 201306; 上海水产品加工贮藏工程技术研究中心，上海 201306; 农业部水产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室(上海)，上海 201306,上海海洋大学 食品学院，上海 201306; 上海水产品加工贮藏工程技术研究中心，上海 201306; 农业部水产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室(上海)，上海 201306 |
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| 摘 要： | 通过对副溶血性弧菌16S r RNA基因序列进行深度分析,研究其序列变异特点,为开发新的分型溯源靶点奠定基础。对111株分离自生鲜水产品的副溶血性弧菌16S r RNA基因测序,与Gen Bank中已有的副溶血性弧菌16S r RNA基因标准序列比对分析,对变异度比较大的序列建立了系统发育树,深入分析了基因的变异规律,并使用ERIC-PCR方法加以验证。不同副溶血性弧菌菌株16S r RNA基因变异主要集中在可变区V1和V2区,50~270 bp的区域内有38个碱基的相似度小于30%,103个碱基的相似度在30%~100%。另外,在V3区和V8区也各有1个碱基有比较明显的差异。副溶血性弧菌16S r RNA基因序列具有一定的变异性,该结果为副溶血性弧菌菌株分型溯源分析提供新的靶点奠定研究基础,同时为其微进化研究奠定理论基础。
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| 关 键 词： | 副溶血性弧菌；16S rRNA基因序列；ERIC-PCR聚类分析；变异规律分析 |
Sequence Variation Regularity Analysis of 16S rRNA Gene of Vibrio parahaemolyticus |
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| FENG Bo,LAN Ying,SUN Xiaohong,ZHANG Weiji,PAN Yingjie and ZHAO Yong. Sequence Variation Regularity Analysis of 16S rRNA Gene of Vibrio parahaemolyticus[J]. Journal of Food Science and Biotechnology, 2016, 35(9): 928-934 |
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| Authors: | FENG Bo LAN Ying SUN Xiaohong ZHANG Weiji PAN Yingjie ZHAO Yong |
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