溴代胞嘧啶对三螺旋DNA稳定性的影响

研究了三螺旋ＤＮＡ中胞嘧啶被５－溴有包嘧啶取代后的稳定性问题。通过建立ＣＧＣ、ＣＧＢｒＣ,ＢｒＧＣ和ＢｒＣＧＢｒＣ４种模型。并２ＩｎｓｉｇｈｔⅡ软件包中的Ｄｉｓｃｏｖｅｒ程度进行计算模拟,骼５－溴胞嘧啶取代三螺肇ＤＮＡ分子中的胞嘧啶后,整个分子的稳定性与有所降低。同时,当用５－溴胞嘧啶取代三螺旋ＤＮＡ不同链上的胞嘧啶时,被取代链的碱基堆积能显著增高,导致分子人稳定性降低,但被取代链和相邻链同相互和     

Web分布式开发模式DNA的探讨

探讨了微软基于Ｗｅｂ应用开发所提出的网络分布计算解决方案ＤＮＡ（Ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｅｄ ＩｎｔｅｒＮｅｔ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ）,并介绍了ＷｉｎｄｏｗｓＮＴ环境下的Ｉｎｔｅｒｎｅｔ／Ｉｎｔｒａｎｅｔ应用解决方案、开发工具及在此模式下开发的办公自动化系统。     

仿生自然计算研究综述

介绍了仿生自然计算这一新兴交叉学科的含义及研究范围,讨论了仿生计算与其它自然计算分枝的关系。将几种常见种仿生自然计算模型,按照人类社会、生物群体、个体、组织器官、细胞、分子等不同的层次进行了分类综述,并介绍了各种算法的最新研究进展。     

浅析DNA计算及其发展状况

近年来,基于生化反应机理的DNA计算模型受到科学领域内许多不同学科领域学者们的关注。DNA计算已经形成国际科学前沿领域内研究的一个新的热点。该文主要讨论了DNA计算的原理,综述了DNA计算的特点、DNA计算模型,并指出了DNA计算研究中存在的问题,最后就DNA计算的发展前景进行了展望。     

计算思维的研究及其进展

计算思维是当前国际计算机界广为关注的一个重要概念,也是当前计算机教育需要重点研究的重要课题。国内外计算机界、社会学界以及哲学界的广大学者对这一课题进行了广泛的研究与探讨,取得了一些积极的成果,但仍有分歧。首先以时间为线索,根据计算思维的形成特点,提出了萌芽时期、莫基时期和混沌时期的阶段划分方法,对计算思维的形成和发展过程进行了全面的分析,给出了计算思维演化进程的一个全景视图;然后重点综述了计算思维的关键内容,包括计算思维的概念、计算思维的原理以及计算思维在教学中的应用等,并进行了总结。最后,结合已有的研究成果,展望了计算思维未来的研究方向及其面对的挑战。     

自然计算发展趋势研究

文章对自然计算的内涵进行了分类归纳,包括进化计算、生物启发计算、群体智能等,指出了各子类最显著的特点。在此基础上,介绍了自然计算最主要研究领域的发展趋势。讨论并证实了自然计算的有效性、内涵的丰富性及其巨大的发展空间。     

Citrix瘦客户机/服务器计算技术在化工计算中的应用

文章介绍了网络计算的发展状况和瘦客机／服务器计算模式的原理，并着重对Citrix瘦客户机／服务器计算技术进行了讨论。Citrix唐客户机／服务器计算模式包括3个关键的组成部分，即多用户操作系统、可将应用程序的逻辑与用户界面分开的有效的计算技术、集中化的应用程序与及用户管理。本文给出了Citrix瘦客户机／服务器计算模式的化工计算中的应用实例。     

DNA计算研究

本文主要讨论了DNA计算原理，综述了DNA计算的特点、DNA计算模型，指出了DNA计算目前存在的问题．最后就DNA计算的发展前景进行了展望。     

基于马尔科夫决策过程的车载边缘计算切换策略

针对车载边缘计算环境中卸载场景的动态变化对计算卸载的影响,提出了一种基于马尔科夫决策过程的计算切换策略,在保证任务完成时间的基础上,对计算卸载的整体过程进行分析,从而进一步降低了计算切换的引入对卸载效果的影响。仿真实验针对计算切换的引入是否有助于提升计算卸载的效果以及如何进一步降低计算切换的引入对计算卸载的影响进行了4种算法的对比,实验结果表明,基于文中提出的计算切换策略,可以提升计算卸载的效率,保证用户的服务体验。     

布告同高性能计算和广域异构资源共享的元计算系统

元计算系统主要用于高性能的计算，实现广域异构网络资源共享，这些资源十分丰富，包括计算机、数据库和昂贵仪器等，随着计算机网络的发展与成熟，元计算正成为网络计算方面的新的研究热点，在国外，元计算的研究已经有相当的基础，提出了概念设计，并开发了一些实验性系统，文章对元计算的研究情况进行了综述，论述了不同元计算系统的设计特点和存在的问题，提出了在国内进行元计算研究应该解决的几个关键问题。     

DNA计算中的数据与计算模型

对DNA计算的通用性及单链、双链、粘性末端、发夹、质粒、k-臂DNA分子等各种数据作了简单介绍,并对基于DNA分子结构特性和基于DNA计算机研制过程两个方面的DNA计算模型进行了分析对比。针对各种不同的DNA数据及特性,提出了混合DNA计算模型的研究思路,并从不同角度论述了混合DNA计算模型的可行性。     

图的最大团与最大独立集粘贴DNA计算模型

粘贴模型(stickermodel)是DNA计算中一个很重要的模型.其主要原理就是采用单双链混合型DNA分子进行编码,其优点在于在生物操作过程中不需要DNA链的延伸,不需要生物酶的作用以及DNA链可重复使用等,因此引起了来自不同学科的学者们的广泛关注与兴趣.文中提出了一种求解图的最大团问题的DNA计算模型,该模型采用了两种基本并行计算处理思想,一种是将图分解成小的子图来处理的并行思想;另一种是进行并行生物操作.     

DNA并行计算中的B-树数据结构的设计与实现

DNA分子特性使得DNA计算具有极大的存储密度和高度的计算并行性。不管何种计算模型,DNA分子的选择和DNA编码都十分重要。提出了DNA计算中的B-树的数据结构设计方法。首先给出了B-树定义及其操作的形式化描述,接着介绍了本计算模型采用的3D结构DNA分子——k-arms分子结构,详细给出了一棵m阶B-树的构造步骤,最后实现了其查找、插入和删除等操作。提出了DNA分子计算的3D结构和分治策略,具有一定的可扩展性和并行性,对DNA计算的其他模型有参考价值。     

DNA逻辑计算模型的研究现状与展望

DNA计算因其优异的计算能力已经成为当前研究热点,DNA逻辑计算模型是DNA计算体系与运算实现的重要依托。按应用技术将现有DNA逻辑计算模型进行分类：基于链置换的DNA逻辑计算模型、基于核酶的DNA逻辑计算模型、基于G-quadruplex的DNA逻辑计算模型、基于DNA自组装的逻辑计算模型、基于其他分子技术和分子材料的DNA逻辑计算模型。首先阐述了DNA逻辑计算的研究背景和研究目的以及现阶段在生物分子检测、疾病诊断、多因素分析和生物成像等领域的应用并简述其相关概念;然后梳理各DNA逻辑计算模型的研究历史和现状,分析各类逻辑计算模型所应用的分子操控技术和分子材料以及优缺点和应用前景;最后归纳总结DNA逻辑计算领域当前研究热点和发展前景,为未来提出全新的计算方式奠定基础,为信息、医疗等领域提供更好的服务。     

计算科学的新领域：DNA计算（Ⅰ）

DNA计算是应用分子生物技术进行计算的新方法。从理论上研究DNA计算方法，有利于推动理论计算科学的发展。本系列文章应用形式语言及自动机理论技术，系统地探讨了DNA分子的可计算性及其计算能力。本文主要介绍常用DNA分子操作方法，并根据DNA分子的结构及特点，给出了DNA分子的形式化描述。     

DNA计算机原理、进展及难点（I）：生物计算机系统及其在图论中的应用

基于生化反应机理的DNA计算机模型受到科学领导内许多不同科学者们的关注与兴趣。DNA计算已经形成国际科学前沿领域内研究的一个新的热点。DNA计算机的研制需要诸如生物工程、计算机科学、数学、物理、化学、信息科学、微电子技术、激光技术以及控制科学等许多学科的共同协作攻关。该系列文章拟对DNA计算机的基本原理、研究进展DNA计算的模型以及当前研究中的难点给予研讨。该文属首篇，重点讨论了DNA计算机的基本原理，引入了生物计算系统的概念，并较系统地讨论了DNA计算模型在图与组合优化中的研究进展。     

DNA计算模型的研究

DNA计算模型在DNA计算的各个研究领域中占有重要的地位,对DNA计算模型进行研究是有意义的。首先回顾了DNA计算模型的发展历史;然后从DNA的基本结构入手研究了DNA计算的机理,并对DNA计算的过程进行了详细分析,从而归纳出DNA计算模型的基本概念;再对DNA计算模型按照DNA计算的物质形态进行了分类并对每一类DNA计算模型的理论及其应用进行了详细的分析。     

DNA计算与DNA计算机研究进展与展望

DNA computing is a new method based on biochemical reactions and molecular biology technology.The paper first introduces the basic principle and advantages of DNA computing, and then surveys DNA computing and DNA computer, finally, points out current existing problems and future search directions of DNA computing and DNA computer.     

Protein output for DNA computing

In recent years, several strategies for DNA based molecular computing have been investigated. An important area of research is the detection and analysis of output molecules. We demonstrate how DNA computing can be extended with in vivo translation of the output. In the resulting proteins, the information per kilogram is about 15-fold higher than in the original DNA output. The proteins are therefore of correspondingly smaller mass, which facilitates their subsequent detection using highly sensitive mass spectrometry methods. We have tested this approach on an instance of the Minimal Dominating Set problem. The DNA used in the computation was constructed as an open reading frame in a plasmid, under the control of a strong inducible promoter. Sequential application of restriction endonucleases yielded a library of potential solutions to the problem instance. The mixture of plasmids was then used for expression of a protein representation. Using MALDI-TOF mass spectrometry, a protein corresponding to the correct solution could be detected. The results indicate the feasibility of the extension of DNA computing to include protein technology. Our strategy opens up new possibilities for both scaling of DNA computations and implementations that employ output of functional molecules or phenotypes.