贵州烤烟种质资源主要特征特性的遗传多样性分析

为进一步挖掘贵州烤烟种质资源潜力,给烤烟新品种选育创造条件,对贵州省烟草科学研究所保存的302份烤烟种质资源主要性状的遗传多样性进行了分析和比较.结果表明,4个形态性状、8个农艺性状、7个化学成分分析指标和6个评吸指标都存在着广泛的遗传多样性.烤烟品种资源在株高、茎围、节距、叶长、叶宽和大田生育期6个性状上的遗传多样性指数(H')较高,存在较大的变异;在化学成分分析指标中,烟碱、总糖、总氮、钾、蛋白质5个指标性状的遗传多样性指数(H')较高,表现较大的变异;在评吸结果中,香气质、吃味、杂气、评吸总分4个指标性状的遗传多样性指数(H')较高,变异较大;并且形态特征性状内的变异也相当丰富,这些都是贵州烤烟种质资源遗传多样性的重要特征.     

基于SSR标记的花生品种遗传多样性分析

从212对SSR标记引物中筛选出48对引物,对63份花生品种进行遗传多样性分析,共得到251个等位变异,变异范围为2~13个,平均每个标记位点有5.23个变异;48个SSR标记的多态性信息含量为0.252~0.873,平均为0.647;63份材料的遗传多样性指数为0.508~2.243,平均值为1.272;品种间的遗传相似系数在0.657~0.960之间,不同类型的花生品种间的遗传相似性较小,不同来源花生品种间的亲缘关系也较远;聚类分析结果表明,63个花生品种在遗传相似系数为0.74处分为4大类,聚类分析结果与传统的花生分类结果吻合。     

钝裂银莲花居群遗传多样性及其与生态因子相关性

采用RAPD技术分析了4个地区(合作、碌曲、玛曲、阿孜)不同花色(黄、浅、白)11个钝裂银莲花居群的遗传结构。结果表明:钝裂银莲花居群遗传多样性较高,Shannon多样性指数(I)为0.6025,Nei’s基因多样性指数(H)为0.4166,Nei’s基因分化系数(Gst)和AMOVA分析表明钝裂银莲花居群间分化程度较低,大部分变异存在于居群内(67%),居群间占一小部分(33%)。对不同居群进行UPGMA聚类分析,结果显示11个亚居群可以归为3大支。相关性分析表明遗传多样性与地理分布和土壤营养状况有相关性。     

甘蓝型油菜2009-2010年候选品种遗传多样性及群体结构

利用45对SSR（简单序列重复）和5对EST（表达序列标签）-STS（序列标签位点）标记对2009-2010年度165份新育成甘蓝型冬油菜品种进行遗传多样性及群体结构分析。50个标记检测到131个多态性片段,每个标记等位变异数由1至7不等,平均为2.62,多态性比率为95.83%,PIC均值0.519 8。165份品种在遗传相似系数0.519 0～0.938 0范围内聚类,平均为0.721 4。全部品种多样性指数Shannon（H）0.314 4,Simpson（I）0.470 3。杂交种整体多样性水平要高于常规种,细胞质不育杂交种略高于细胞核不育杂交种。4个生态区域中华东地区所育品种的两种指数最高,分别为0.314 0（H）和0.466 3（I）,西北地区最低,为0.271 1（H）和0.405 9（I）。主成分（PCA）以及群体结构分析均显示细胞核不育杂交种与细胞质不育杂交种两种类型间以及中南与西北区域细胞质不育杂交种间存在遗传差异。165份材料群体结构分为8个组。组Ⅰ中质不育杂交种占50%,核不育杂交种和常规种各占近25%;组Ⅱ、Ⅳ、Ⅵ、Ⅶ基本为细胞质不育杂交种;Ⅲ、Ⅴ、Ⅷ三个组以细胞核不育杂交种为主。在细胞质不育杂交种为主的组中,西北区域与中南区域育成品种存在较明显的遗传差异。细胞核不育类型品种为主的3个组显示出更为复杂的遗传背景。     

草菇有性世代间rDNA序列变异分析及RAPD分析

草菇的遗传与有性生殖过程存在很多的特殊性和不确定性,本研究以草菇V23菌株的成熟子实体弹射孢子,单孢分离后得13个单株,分别摇瓶培养、收集菌丝,提取总DNA,用通用引物ITS4、ITS5进行PCR扩增后连接、转化并测序,将单孢间和单孢与亲本间的ITS序列进行比对,分析草菇ITS序列多样性及变异性;同时以相应单孢菌株DNA为模板,用20条随机引物进行RAPD扩增。结果表明:草菇单孢间和单孢与亲本间的ITS序列相似度均在99%以上,相较于亲本的ITS序列,单孢序列中发现了有5个位点出现碱基转换,但没有两个以上的单孢发生同一转换;20条随机引物分别与14个样本进行RAPD扩增,其中3个引物出现多态性条带,带型结果发现单孢菌株间的带型差异呈现一定规律。草菇ITS序列变异较少,不适于单孢间的变异分析,而RAPD方法对摸索草菇有性世代间的遗传分离规律有重要价值。     

中国莲子种质资源遗传多样性的RAPD分析

利用RAPD标记对收集自全国不同地区的22个莲子(NympheaceaeNelumboAdans)栽培品种及野生品种的遗传多样性进行了分析。结果表明:筛选出的14个随机引物扩增出109条DNA指纹谱带,其中83条为多态性片断,为总数的76.1%。应用PhylTools统计数据软件进行差异条带的遗传距离系数分析,构建遗传距离系数矩阵,然后用PHYLIP软件包(版本3.573c)非加权配对算术平均法(UPGMA)进行聚类分析并绘制聚类树状图,供试品种可以划分为五大类,其中江苏水选1号、建宁莲3号、建瓯莲分别单独为一类,其它19种聚为二类。从中可看出品种间的遗传距离与收集地区没有直接的关联,该研究为莲子育种提供重要的信息。     

烤烟品种的RAPD引物筛选

本试验筛选出了45个引物,可产生遗传多样性,其中OPA-08、OPA-16、OPC-10、OPC-12、GENMES'S 36号、78号、112号、181号引物其扩增结果稳定性好、多态性强。这些引物的RAPD扩增结果都可作为烟草烤烟品种的遗传多样性分析、基因定位及分子标记等。经凝胶电泳比较,GENMED'S 36号引物可作为烟草品种的最适宜的引物;1.8kb条带被初步认为与抗黑胫病基因相关。这些结果为以后对烟草烤烟品种在分子水平上的研究奠定了基础,加速烟草烤烟品种分子水平上的研究进程      

田间不同繁殖代数烟草赤星病菌毒力变异的遗传本质

为弄清烟草赤星病菌毒力与DNA多态性的关系及田间不同繁殖代数烟草赤星病菌毒力变异的遗传本质,分别采用毒力测定和RAPD技术对采集于同一烟田不同生长期的6个烟草赤星病菌株进行测定。结果表明,田间赤星病菌繁殖代数越高毒力越强,毒力差异是病菌基因组DNA致病相关基因差异所致。根据供试菌株在3个烟草品种上的毒力反应,可将其分为2个组,利用RAPD标记可将其分为3个组。12个随机引物扩增供试菌株共产生105个RAPD标记,其中多态性标记占95.24%,表明烟草赤星病菌群体中具有丰富的遗传多样性,毒力多态性与DNA多态性之间存在一致性,但也存在一定的差异。     

十个白灵菇栽培菌株的遗传多样性分析

本研究采用RAPD 技术对10 个不同的白灵菇株系进行遗传多样性分析。经过筛选得到的4 种随机引物共扩增出52 条DNA 片段,其中多态性条带44 条,多态性位点频率为84.6%,说明通过RAPD 扩增获得的白灵菇10个株系的遗传指纹图谱多样性丰富。利用Popgen32 生物学软件计算各株系间遗传距离并构建系统进化树,在分子水平上确定了10 个白灵菇株系间的亲缘关系,可为进行更科学、准确分类提供参考依据。     

广西地方葛根种质资源遗传多样性的SCoT分析

为了解广西地方葛根种质资源之间的亲缘关系,本研究以SCoT分子标记对44份广西葛根种质资源的基因组DNA进行PCR扩增,并进行遗传多样性分析。结果表明,25条SCoT引物共扩增出223个条带,其中具有多态性的条带有194条,平均每条引物获得776个多态性条带,多态性比例为86.99%。聚类分析表明,44份葛根种质资源的遗传相似系数在0.587～0.982之间。在系数0.65处,44份葛根分为两大类,37号材料单独成为一类;在系数为0.74处,可聚为六类。综上所述,SCoT分子标记适用于葛根种质资源遗传多样性分析,本研究结果为广西葛根种质资源鉴定评价和新品种选育奠定了一定的理论基础。     

利用ISSR分析贵州部分烟草品种(系)的遗传关系

利用ISSR标记,对12个贵州地方品种(系)和5个贵州主要种植品种分析亲缘关系。结果显示,有23条ISSR引物在烟草上能扩出清晰条带,其中9条引物能扩增出明显多态,能把17个品种(系)区分开。利用NTSYS 2.0软件对多态条带进行统计;用SimQual计算遗传相似系数,遗传相似系数在0.2127~0.7872之间变动。根据UPGMA进行聚类分析结果表明,17个品种(系)可以分为3个组群。     

基于ISSR标记的云南紫苏资源的遗传多样性研究

利用14条引物对滇产16份紫苏资源的遗传多样性进行ISSR分析,共扩增出128条条带,其中81条为多态带,平均多态率为62.54%,表明云南紫苏资源的遗传多样性程度较高。采用SPSS16.0软件分析,16份滇产紫苏资源间的Rogers-Tanimoto相似性系数界于0.463～0.882之间。UPGMA法聚类将16份紫苏资源分为5类,分别对应紫苏种下的5个变种,研究结果为云南紫苏种下变种的分类提供了分子水平的依据。     

云南省烟草镰刀菌根腐病菌遗传多样性分析

  背景和目的  尖孢镰刀菌（Fusarium oxysporum）引起的根腐病是烟草主要的土传病害,在云南烟区普遍发生。为分析云南省不同地理来源尖孢镰刀菌的遗传差异性和亲缘关系。  方法  采用ISSR（inter-simple sequence repeat）和SRAP（sequence- related amplified polymorphism）分子标记技术分析40株菌株遗传多样性。  结果  （1）采用ISSR技术,供试的7条引物共扩增出53条条带,其中多态性条带44条,平均多态性条带83.02%。菌株间的遗传相似系数为0.49~0.96,存在遗传背景差异。遗传相似系数为0.68时,40株菌株可分为3个类群。（2）采用SRAP技术,供试的7对引物共扩增出44条条带,其中多态性条带32条,平均多态性条带72.73%,菌株间的遗传相似系数为0.55~0.96。遗传相似系数为0.70时,40株菌株可分为3个类群,结果与ISSR一致。  结论  云南省烟草尖孢镰刀菌菌株间遗传差异大,ISSR和SRAP分子标记技术可用于烟草尖孢镰刀菌的遗传多样性分析。      

Molecular characterization of mulberry (Morus spp.) genotypes via RAPD and ISSR

BACKGROUND: In recent years, DNA‐based markers have been used quite extensively because of their many advantages over the traditional morphological and biochemical markers. Many studies have shown that molecular markers are useful in delineating the genetic relationships among closely related mulberry genotypes and cultivars. Thus, in the present study, polymer chain reaction based DNA fingerprinting techniques were used to investigate the genetic relationships among mulberry genotypes growing in different agro‐climatic regions of Turkey. RESULTS: 20 RAPD primers generated a total of 173 bands, of which 157 (90.75%) were polymorphic. As for 11 ISSR primers, 124 bands (96.55%) were polymorphic in a total of 128. The similarity index for RAPD technique ranged between 0.24–0.98; 25?s203 with 25?s112 were found to be the closest genotypes, while 24Ke10 and 25?s123 were the most distant ones. According to the ISSR result, the genetic similarity index changed between 0.21–095; 25?s203 with 25?s112 genotypes were the closest, while 25?s08 and 01KaD2 were the most distant ones. CONCLUSION: The RAPD and ISSR markers were found to be promising for assessing genetic diversity in mulberry genotypes. Copyright © 2011 Society of Chemical Industry     

用SRAP标记研究烟草种质资源的遗传多样性

用15对SRAP引物组合对46个普通栽培烟草品种,包括30个普通烟草栽培种和16个黄花烟草进行了多态性分析,共获得3036条带,其中多态性条带为636条,每对引物平均提供42个多态性标记信息。基于UPMGA方法得到的聚类分析结果表明46个烟草品种间的遗传相似系数为0.67～0.98,聚类分析可将这46个品种划分为2个大类群,同种类型的烟草基本聚合在同一种类群中,表明SRAP标记是适合烟草种质资源遗传多样性研究的。     

4个引进甜菜品种DNA指纹图谱的建立

利用ISSR标记技术,对4个引进的甜菜品种建立DNA指纹图谱。结果显示,用筛选出的1条引物的PCR扩增指纹图谱即可将这4个品种区分,该引物共扩增出12个清晰条带,其中6个为共有带,多态性为50％,4个品种分别有自己的特征带。研究结果表明,利用ISSR标记指纹能够从DNA水平上明确区分甜菜不同品种,为甜菜种质鉴定提供了一种有效方法。     

西藏野生油菜遗传多样性分析

利用10对AFLP引物及13对SSR引物,分析了43份来自西藏地区部分野生类型油菜种质的遗传多样性。10对AFLP引物共得到276条清晰的谱带,其中多态性带214条,多态性位点比率为77．5％,平均每对AFLP引物得到21．4条多态性带。13对SSR引物共扩增出57条带,其中多态性带51条,多态性位点比率为89．5％,说明西藏野生油菜遗传多样性丰富。通过对西藏野生类型油菜资源的遗传距离以及聚类分析,可将西藏野生类油菜分为两大类群,分别为白菜型和芥菜型野生油菜种质资源;两种分子标记适合揭示西藏野生油菜的遗传多样性。     

8种抗寒平欧杂交榛子油脂成分分析及比较

比较8种平欧榛子的差异性,利用索氏提取法测定油脂含量,气相色谱法和比色法进行油脂脂肪酸组成和α-VE含量分析,聚类分析用于区分其类别。结果表明:8种平欧榛子有显著差异,含油量平均为56.36%,范围为52.92%~59.24%;单不饱和脂肪酸、多不饱和脂肪酸、饱和脂肪酸的平均相对含量分别为72.54%、16.11%、7.85%;最丰富的脂肪酸是油酸,平均相对含量为72.29%,亚油酸与油酸总含量超过85%;α-VE含量为113.42~285.16μg/g。用3个主成分PC1(43.384%)、PC2(34.436%)、PC3(12.606%)作为合成变量通过聚类分析可得到4个类群:4#、5#、6#、7#为一类,8#为一类,2#、3#为一类,1#为一类。     

尖孢镰刀菌胡麻专化型（Fusarium oxysporum f.sp.lini）ISSR标记聚类分析

结合形态学特征和分子生物学方法对我国尖孢镰刀菌胡麻专化型菌株进行鉴定、聚类分析和遗传变异分析。结合传统分类方法和ITS序列分析,确定6省区96株菌株为尖孢镰刀菌。采用ISSR（简单重复序列区间）分子标记技术对这96株菌株进行分析,12条引物共扩增出800个条带,多态率条带数为797条,多态率为99.62%;在相似性系数为0.88处,96株供试菌株被分为5个类群。聚类结果表明,胡麻枯萎病菌种内存在明显的多态性,且ISSR类群与地理来源存在相关性。