维吾尔族人群LPL基因PvuⅡ多态性与身体测量和血生化指标的相关性研究

目的探讨脂蛋白脂酶(lipoprotein lipase,LPL)基因PvuⅡ酶切位点多态性在塔克拉玛干沙漠腹地健康维吾尔族人群中的分布特征及其与身体测量和血生化指标的相关性,并与不同种族人群进行比较。方法采用PCR-RFLP方法检测99例健康维吾尔族人群(男性38例,女性61例)LPL基因PvuⅡ酶切位点的多态性。结果新疆99例健康维吾尔族人群中以P+等位基因多见,频率(52.02%)高于P-等位基因频率(47.98%),三种基因型中以P+P-基因型最为多见(61.62%),其次为P+P+基因型(21.21%),最低是P-P-基因型(17.17%),且各基因型和等位基因频率在男女中分布无显著性差异(P>0.05);男性中P-P-基因型组空腹血糖水平显著高于P+P+和P+P-基因型组,各基因型与空腹血糖有显著性差异(χ~2=3.411,P<0.05),在女性中P-P-基因型组总胆固醇水平显著高于P+P-和P+P+基因型组,各基因型与总胆固醇有显著性差异(χ~2=4.669,P<0.05),其他各项身体测量和生化指标均未见显著性差异(P>0.05);而LPL基因PvuⅡ酶切位点多态性在维吾尔族人群中的分布与海南汉族人群、大连汉族人群、郑州汉族人群、海南黎族人群等不同民族人群比较均存在显著差异(P<0.01,P<0.05);与日本、中国汉族、韩国、阿拉伯、土耳其等不同种族人群比较也均存在显著差异(P<0.01,P<0.05),而与芬兰和印度人群比较的差异无显著性(P>0.05)。结论 LPL基因PvuⅡ酶切位点P-P-基因型和P+等位基因在健康维吾尔族人群中的分布可能与空腹血糖、总胆固醇等血脂水平相关联。     

纤维素酶分子的计算机辅助序列分析

利用生物大分子数据库（EMBL、SWALL和PDB）及软件技术（DNASIS和AntheProt）对嗜热子囊菌（Thermoascus aurantiacus)的产生的一种纤维素酶分子进行了序列分析及结构预测；通过多种来源的纤维素酶的比较研究，分析了其催化区、活性位点及局部保守序列。     

测井现场绘图软件的面向对象设计与实现

在面向对象的软件设计中,多态性是一种非常重要的概念,文章论述用封装、继承和多态性来实现测井绘图软件的设计和开发,实现不同测井图像连续绘制。测井绘图软件能够对不同的测井图像实现动态兼容,提高了软件系统整体的扩展性。     

除草剂对植物和动物共有靶标的毒性机制

除草剂对哺乳动物和植物的毒性是通过对靶标位点的作用而产生的,目前已发现了近20种不同的除草剂作用机制,它们的靶标位点有些是植物所特有的,有些是哺乳动物和植物以及微生物所共有的。就这些除草剂的作用机制进行了系统的阐述,比较了它们对植物和哺乳动物的相对活性,以及如何确定它们的毒性。同时,除靶标位点外,除草剂的吸收、传导、代谢和降解也是影响毒性的重要因素,对这些因素的研究也有助于提高对非靶标生物的安全性。     

美洲大蠊神经索中与呋虫胺高亲和性结合位点的鉴别

1．背景新烟碱类杀虫剂作为烟碱型乙酰胆碱受体(nAChRs)激动剂具有广谱的杀虫效果,它对昆虫的nAChRs具有选择性,而对哺乳动物低毒。这种选择作用可能是由于昆虫和哺乳动物的nAChRs在结构上存在的微小差异。     

金属离子(Na+、K+、Mg2+、Ca2+)与鸟嘌呤活性位点相互作用的理论研究

本文用量子化学从头算方法对金属离子与碱基活性位点的相互作用及其形成配合物的结构和性质进行理论研究.用HF/6-311G*优化鸟嘌呤及其金属离子(Na 、K 、Mg2 、Ca2 )配合物.在HF水平上,运用6-311G*基组计算Ⅰa和Ⅱa族金属离子(Na 、K 、Mg2 、Ca2 )与鸟嘌吟(Guanine)活性位点的相互作用.结果表明:Mg2 、Ca2 离子引起配位体的变形较Na 、K 离子大;Mg2 、Ca2 离子配合物比Na 、K 离子配合物稳定.     

Aerobic biodegradation of di-n-butyl phthalate by Xiangjiang River sediment and microflora analysis

Di-n-butyl phthalate (DBP), one of phthalate acid esters (PAEs), was investigated to determine its biodegradation rate using Xiangjiang River sediment and find potential DBP degraders in the enrichment culture of the sediment. The sediment sample was incubated with an initial concentration of DBP of 100 mg/L for 5 d. The biodegradation rate of DBP was detected using HPLC and the degraded products were analyzed by GC/MS. Subsequently, the microbial diversity of the enrichment culture was analyzed by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP). The results reveal that almost 100% of DBP is degraded after merely 3 d, generating two main degraded products: mono-butyl phthalate (MBP) and 9-octadecenoic acid. After a six-month enrichment period under the pressure of DBP, the dominant family in the final enrichment culture is clustered with the Comamonas sp., the remaining are affiliated with Sphingomonas sp., Hydrogenophaga sp., Rhizobium sp., and Acidovorax sp. The results show the potential of these bacteria to be used in the bioremediation of DBP in the environment.     

基于Logistic回归惩罚函数的遗传位点分析

探讨将基于惩罚函数的变量选择方法应用到遗传位点分析.以2016年9月16日的全国研究生数学建模竞赛B题的数据为例,首先对每个位点的碱基对(A、T、C、G)编码方式数值化处理,最后用数值化后的数据进行建模,并将单变量选择Logistic SCAD、组变量选择Logistic Group SCAD模型和双层变量选择Logistic cMCP模型定位到与遗传性疾病显著相关的遗传位点,分别与出题者提供的标准答案进行对比,结果显示双层变量选择Logistic cMCP模型能够准确的定位到与遗传性疾病显著相关的遗传位点.因此将其运用到具有遗传性疾病和性状的遗传位点分析是值得研究的.     

面向信息SNP选择的聚类算法

SNP数据在人类遗传病诊断与治疗中存在重要作用,但SNP原始数据存在大量冗余,因此需要选择出信息量大的SNP,完成SNP数据的降维.针对常用聚类算法应用到信息SNP选择时未考虑单个SNP与SNP子集之间相似度的问题,采用一种新的相似度度量方法,提出了一种改进的聚类算法K-MIGS,并将其应用到SNP选择中.K-MIGS算法解决了传统K-means不能挖掘出SNP位点与SNP子集之间的强相关性问题,并在医院提供的临床数据实验中表明,K-MIGS具有更高的非信息SNP子集重构度.最后使用支持向量机、决策树和神经网络对构造的SNP子集进行分类实验,对比K-means、特征加权K-means、ReliefF和MCMR,结果表明K-MIGS分类准确率和F1指标上提升了10％和15％,充分说明K-MIGS在信息SNP选择中具有更好的效果.     

基于弹性网络模型的蛋白质结构-功能关系

蛋白质结构-功能关系研究是结构生物学领域的热点问题之一,具有重要的理论和实际应用价值.弹性网络模型(elastic network model,ENM)是获取蛋白质结构本身固有动力学性质,进而揭示其生物学功能的有效方法,在蛋白质结构-功能关系研究中得到了广泛应用.简要介绍了ENM的基本原理及其在蛋白质结构-功能关系中的应用,主要包括蛋白质功能性运动分析和关键位点识别等.