基于混合二阶隐马尔可夫模型的基因结构预测

在基因预测时,待研究的生物序列中的残基(氨基酸或核甘酸)具有高度的相关性,因此,观测噪声和马尔可夫链不相互独立的条件下的混合隐马尔可夫模型比普通隐马尔可夫模型更适用于基因预测功能.介绍了一种基于混合二阶隐马尔可夫模型(HMM2)的基因识别系统,该系统的预测精度在在核苷酸和外显子水平上均与国外同类研究水平相当.     

基于景观基因理论的湘南地区现代乡村规划建设研究

当前,现代乡村规划建设大多注重 以现代技术和理念塑造现代生活环境,对于 历史脉搏的挖掘与继承多有忽视,造成历史 文脉和地方特色延续的断代。研究以湘南地 区为例,尝试引入传统聚落景观基因理论与 现代乡村规划相结合,在宏观规划和微观建 筑两个层面十二项指标挖掘并集成景观基因 图谱,探求其在现代规划中的指导应用,得出 “因子整合—可行性筛选—科学性变异—移 植结合”的基本应用思路,提出对规划选址、 居民点规划、空间规划、景观规划和建筑平 面设计、立面设计、构件材质设计等七大要素 的应用机制,以解决湘南村庄规划建设过程 中出现的空间环境失调和地方特色缺失等问 题,为现代乡村规划建设提供参考和借鉴。     

文化人类学视角下水西彝族土司建筑的基因解读

物质空间的特征是一种由内在文化 基因决定而呈现出来的显性性状,传统地域 性建筑是特定时代和地区的产物,其营建活 动在“文化基因”传递过程中起到关键作用。 因此,本文以文化人类学作为理论视角,借以 “文化基因”的概念,以水西“土司建筑”这 一地域性建筑为例,探讨物质空间背后的建 筑文化动因,再抽取三个层面的文化基因进 行隐含基因和显性性状之间的互推互证,为 从文化人类学的角度研究建筑内部的文化基 因提供一个参考范式,对于全面认识土司建 筑这一传统地域性建筑以及对其的保护具有 一定的作用。     

牛乳中不同部分蛋白质的组成及功能分析

本研究通过SDS-PAGE电泳将牛乳中不同蛋白质组成部分进行分离鉴定发现,乳脂肪球膜中存在201种蛋白,乳清中存在96种蛋白,酪蛋白中存在21种蛋白,乳粒中存在43种蛋白,其中有27种相同表达的蛋白。通过GO功能注释分析发现,在生物过程中乳脂肪球膜蛋白发挥的作用大于乳清、乳粒蛋白,尤其是生物的调控作用;在分子功能上,牛乳蛋白的主要分子功能是结合作用,其中乳脂肪球膜蛋白的结合作用最强;而乳粒蛋白参与的转运活性分子功能大于乳脂肪球膜、乳清蛋白。在细胞组成上,与乳清、乳粒蛋白相比乳脂肪球膜蛋白参与的细胞组成均较多,而在细胞膜的组成上乳粒蛋白参与较多。通过京都基因与基因组百科全书(KEGG)代谢通路分析可知,乳脂肪球膜、乳清、乳粒中的蛋白均参与过氧化物酶体增殖物激活受体信号通路。对牛乳蛋白质组成进行研究,不仅能够增加牛乳的利用率,并且为日后以乳脂肪球膜、乳粒蛋白作为原料生产乳制品提供理论依据。     

乳铁蛋白研究现状

文章综述了乳铁蛋白最新研究成果，主要包括乳铁蛋白分子结构、分离提取方法、生物学功能、乳铁蛋白基因及重组乳铁蛋白的研究现状，介绍了乳铁蛋白及其活性多肽（抗菌肽、促进细胞生长肽）的抗微生物（细菌、病毒、真菌）作用、促进细胞生长作用、免疫增强作用、抗氧化及抗肿瘤作用、参与铁代谢过程等作用，对铁蛋白在临床及食品工业中的应用作了分析。     

2000-2005年广东省食品中食源性致病菌的监测与分析

为了解广东省食品中食源性致病菌的污染状况和污染水平。按国家监测网的工作手册进行了食源性致病菌的检测和菌密度测定,应用RiboPrinterMicrobial Characterization System检测分离菌株的基因指纹图谱,纸片法作药敏试验。在监测的10类2265份食品中,共分离出76株沙门菌、75株单核细胞增生性李斯特菌、161株副溶血性弧菌、2株空肠弯曲菌、2株O157∶H7大肠杆菌。5种食源性致病菌的检出率为13.95%。部分分离的菌株基因指纹图谱分析的结果是:58株沙门菌分属于22个血清型,25株单核细胞增生性李斯特菌分属于11个RP基因型,55株副溶血性弧菌分属于14个RP基因型。药敏试验结果显示,沙门菌、副溶血性弧菌、O157∶H7大肠杆菌均有多重耐药株,单核细胞增生性李斯特菌对抗生素产生耐药性的比例较低。沙门菌、单核细胞增生性李斯特菌和副溶血性弧菌阳性样品中的几何平均菌密度分别为265、96CFU/g和93MPN/100g。5种食源性致病菌对广东省食品的污染普遍存在。肉类食品和水产品的污染尤为严重,政府相关部门应尽快对畜牧养殖业抗生素的使用进行科学指导,并制定相关的法规进行监督和约束。     

宁波市小水产品中副溶血性弧菌的血清型、毒力及耐药性研究

目的了解宁波市小水产品中副溶血性弧菌血清群分布、产毒素特性及耐药性,为防治副溶血性弧菌引起的食源性疾病提供依据。方法参照GB/T4789.7—2003用标准血清和PCR进行分型,用PCR测定tdh和trh毒力基因;用纸片扩散法进行药敏试验。结果27株副溶血性弧菌分属于9个血清群,分别为O∶4群占33.3%(9/27)、O∶3群占14.8%(4/27)、O∶2群占14.8%(4/27)、O∶11群占11.1%(3/27)、O∶5群占7.4%(2/27)、O∶1群占7.4%(2/27)、O∶7群占3.7%(1/27)、O∶9群占3.7%(1/27)、O∶10群占3.7%(1/27)。27株副溶血性弧菌的tdh与trh毒力基因均阴性。药敏试验结果显示,27株副溶血性弧菌对青霉素类、β-内酰胺类、氨基糖苷类、磺胺类、喹诺酮类、头孢类药物都有耐药株出现。结论宁波市小水产品分离的副溶血性弧菌具有血清分群多样性,药敏结果多重耐药性的特点。     

商都文化复兴视角的城市设计研究--以天河路商圈整体城市设计为例

全球化和信息化双重冲击给中国城市地域文化和历史特征延续造成巨大危机。对地方文化基因的重新认知、提炼、抽象和组织重构,并对新城市文化进行储存、流传和创造性表达将是重建地方独特价值的关键。天河路商圈整体城市设计从复兴广州“千年商都”文化的视角出发,提出“六大文化特色片区”架构,结合开放空间设计和公共服务设施规划引导城市发展,并通过在核心节点创造“城市事件”场所和景观凸显新商都文化精神和城市艺术氛围。     

牛初乳与牛乳中乳清蛋白质组成及功能的对比分析

乳清富含多种功能特性和生物活性的蛋白质,本研究利用SDS-PAGE电泳将牛初乳与牛乳中乳清蛋白质的组成部分进行分离鉴定,发现牛初乳与牛乳中乳清蛋白质的组成存在较大的差异,且在牛初乳乳清中鉴定出290种蛋白,牛乳乳清中鉴定出325种蛋白。由GO功能注释分析发现,在生物过程中,牛初乳乳清蛋白在细胞定位建立和细胞定位中的作用略高于牛乳乳清蛋白。在分子功能上酶抑制活性作用是牛初乳乳清蛋白和牛乳中乳清蛋白的主要分子功能。在细胞组成上牛初乳乳清蛋白参与较多的是细胞外部分和细胞外空隙,与牛乳乳清蛋白相比参与的细胞组成大体相同。通过KEGG代谢通路分析可知,牛初乳和牛乳乳清蛋白均参与过补体及凝血级联反应通路。对牛初乳乳清蛋白组成进行研究,不仅能够增加牛初乳的利用率,并且为日后以乳清蛋白作为原料生产乳制品提供理论依据。