基于复杂网络的合成致死预测方法研究综述

合成致死(Synthetic Lethality,SL)是一种负遗传相互作用,描述的是两个非必要基因之间的相互关系:其中任何一个基因的突变对细胞存活的影响很小,但两个基因的共同突变会导致细胞死亡或其他有碍细胞存活的表型.SL对于解释复杂生物过程、推动癌症的临床诊治有着重要的意义.因此,利用海量的高通量数据,通过构建数据分析模型和计算方法,从计算的角度进行SL对的挖掘和预测,是计算生物学研究的一个重要方向.本文首先对于SL预测所使用的相关数据进行了详细的综述,然后从生物网络这一全新视角出发,重点讨论了基于网络分析的SL预测方法.从网络上的统计学方法、基于网络结构变化的方法、基于网络特征学习的方法、基于图表示学习的方法四个方面综述了相关预测模型和研究的最新进展,详细地比较了各类方法的算法思路、应用场景和优缺点,最后针对SL预测的结果评估和验证方法的研究进展进行了论述.在此基础上,论文进一步总结出SL预测研究中所面临的几项挑战,并针对性的对未来发展方向进行展望,希望为今后的相关研究提供一些有用的参考和思路.     

羰基合成醋酸色度超标的控制方法分析

对羰基合成醋酸色度超标的控制方法进行分析,运用技术改造和操作优化的方式,对羰基合成醋酸产品在色度超标上的原因,以及如何采用羰基合成醋酸色度超标控制的工艺、方法,降低羰基合成醋酸成品中铁离子和碘含量,达到对羰基合成醋酸产品色度稳定的目标,实现优质的羰基合成醋酸有机产品的生产。     

磷酸西格列汀的酶法合成工艺改进

磷酸西格列汀的酶法合成工艺是美国Merck公司与Codexis公司合作开发的一条绿色高效合成途径。主要在酶法合成工艺基础上进行改进,具体通过可表达转氨酶的重组大肠杆菌BL21(ED3)培养获得菌泥,经破碎后投入催化反应,底物转化率达95.83%。调酸性分离使有机杂质含量低于1.0%,调碱性分离西格列汀,与磷酸成盐后精制得到磷酸西格列汀一水合物,收率84.6%,ee99.99%,综合回收并使用二甲基亚砜与异丙醇。改进后相比文献方法提高约3%的转化率,明显降低了生产成本,适用于大量生产,为同类型酶催化工艺设计提供了一个新的思路。     

Pyrimidine:基于面向对象的遗传算法Python框架

Pyrimidine是开发用于实现遗传算法的通用框架.它也可以实现任何迭代模型,如模拟退火、粒子群算法.它的设计基于面向对象,利用了Python的元编程功能把群体看成个体的容器,又把个体看成染色体的容器,而容器是一个元类,用来构造不同结构的个体类和群体类,因为它是高度面向对象的,所以它容易扩展、改进.     

基于APD的2.5D封装中介层自动化设计

由于高带宽存储器(High Bandwidth Memory,HBM)的高带宽特性,在2.5D封装中介层(Interposer)的版图设计过程中存在大量HBM接口的连线需要手动完成。介绍了如何使用SKILL语言在Allegro封装设计工具(Allegro Package Design,APD)中实现HBM接口的自动布线,将原来的手动布线时间从2周缩短到10 min,大大压缩设计周期。     

粉煤灰分子筛的制备及其研究

从粉煤灰预处理方法、沸石分子筛合成方法及其应用领域等三个方面综述了最新的研究进展。由于来源不同的粉煤灰物理性质、化学性质差异较大,常采用不同的预处理方法,为合成高品质沸石分子筛奠定基础;进而总结了不同合成方法与分子筛种类、性能之间的关系及其优缺点;阐述了粉煤灰沸石分子筛在重金属去除、催化剂载体、渗透反应格栅、衬垫等方面的应用前景。提出了利用工业废弃物粉煤灰制备沸石分子筛的过程中需要注意的问题及未来发展方向。