花椒果皮基因组DNA提取: 不同试剂盒性能评估与比较研究

摘 要: 目的 通过比较不同植物试剂盒在花椒果皮DNA提取中的差异, 探究适用于花椒果皮的基于离心柱法的DNA提取试剂盒。方法 选取8种不同品种的花椒, 利用TIANGEN DNAsecure新型植物基因组DNA提取试剂盒(Tiangen-Ⅰ)、DNeasy Plant Mini Kit (DNeasy)、多糖多酚植物基因组DNA提取试剂盒(Tiangen-Ⅱ)、Nucleospin ? Food kit (Nucleospin) 4种基于离心柱法的试剂盒提取花椒果皮基因组DNA, 通过对比提取到的DNA浓度、纯度、聚合酶链式反应扩增能力, 以及提取过程中的成本、耗时等因素, 基于简单加权(simple additive weighting, SAW)分析对比不同试剂盒对于花椒果皮DNA的提取的效果, 并进行综合评分。结果 不同试剂盒各有优缺点, 最终Tiangen-Ⅰ试剂盒得分1.64, 排名第一, 综合考虑价格、所用时间与提取得到的DNA质量, Tiangen-Ⅰ试剂盒是更适用于花椒果皮DNA提取的试剂盒; 同时, Nucleospin试剂盒在提取得到的花椒DNA质量方面有着较好的表现。结论 本研究以花椒为例探究干扰组分较多植物的基因组DNA试剂盒提取方案, 通过比较Tiangen-Ⅰ试剂盒被推荐作为最佳选择, 本研究为花椒果皮及其他相似植物的基因组DNA提取提供了参考方案。