美国开发快速锁定食源性疫情源头的数据库

据美国食品安全新闻网报道,为应对食源性疫情,目前美国食品药品管理局联合加州大学以及安捷伦公司,正在开发一个可快速锁定食源性疫情源头的数据库,名为"十万个基因组工程"。由以上三家单位联合发起的这个项目可以迅速查明食     

清香型大曲淀粉水解酶系解析

对清香型大曲中可能存在的淀粉代谢相关酶类及各自催化作用进行全面分析,并从Brenda数据库中搜索酿酒相关的淀粉水解酶,了解不同来源淀粉水解酶类的酶学特征,并从基因组角度分析酿酒微生物合成的淀粉代谢酶类,对酿酒微生物有更深入的认识,为选育理想的酿酒微生物提供理论依据。     

微生物降解植物甾醇侧链生产雄甾烯二酮的研究进展

甾体激素类药物是我国医药领域的重要门类,雄甾烯二酮是甾体激素类药物不可替代的中间体。微生物选择性降解植物甾醇侧链生成雄甾烯二酮,能替代复杂的多步化学合成法,并减轻目前由于薯蓣皂素为原料造成的资源紧缺,对合理利用我国的甾体植物资源,推动制药行业的发展有着重要的意义。本文结合相关的研究进展,综述了微生物选择性降解植物甾醇侧链菌种的选育与改良,水相体系中转化条件的优化及几种非水相转化系统的研究状况,并针对传统诱变育种耗时、费力、正突变率低、突变性状比较分散等缺陷,提出通过基因组改组技术实现突变性状优化重组,为构造甾醇微生物转化高产菌种提供广阔的发展空间。     

利用蛋白质同源性搜索检验细菌预测基因的起始位点

细菌基因组中基因密度高、结构相对简单,基因预测可以达到较高的准确度。细菌基因预测的一个重要问题是难以准确判断基因起始位点,目前应用最广的基因组自动注释方法给出的结果中,占总数约1/5的基因的起始位点有分歧,尚无利用基因结构的统计特征改进起始位点预测的有效方法。通过蛋白质同源性搜索,为推断起始位点提供新的线索。对氧化葡萄糖酸杆菌Gluconobacter oxydans 621H全基因组的分析表明,这种方法可以实质性改善起始位点预测结果。     

巴氏杜氏藻八氢番茄红素合成酶侧翼调控序列的克隆与分析

研究表明八氢番茄红素合成酶( PSY)是巴氏杜氏藻(Dunaliella bardawil)类胡萝卜素代谢途径中的第一个关键调节酶.本实验采用基于LAoPCR的基因组步移法分别设计两组基因特异引物pSP1-3及tSP1-3,克隆巴氏杜氏藻PSY( DbPSY)的启动子和终止子序列,并利用在线启动子分析软件分析其保守调控序列.最后利用生物信息学方法分析预测DbPSY的蛋白质结构.分析结果表明,DbPSY启动子具有两个保守调控序列:BOXLCOREDCPAL和GT1GMSCAM4,其中BOXLCOREDCPAL受紫外光诱导,上调下游基因的表达,GT1GMSCAM4受盐调控,促进下游基因的表达.蛋白结构分析表明,DbPSY的N端在邻近物种间具有较大的多样性.我们推测DbPSY的微调与启动子保守序列及蛋白质N端序列的多样性相关.     

美国能源部资助从纤维素生物质制取氢气和乙醇项目

美国能源部(DOE)于2008年11月13日宣布向Rochester大学教授David Wu资助175万美元以资助从纤维素生物质制取有用的氢气或乙醇项目,这些废弃生物质可为牧草修剪料、谷物秸杆和木屑。David Wu已研究了一种厌氧、喜热、可分解纤维和可生成乙醇的细菌C.thermocellum。结合其喜     

打破传统分界

农业中的传统垂直市场的界线正在被逐渐打破。农用化工公司和种子公司正越来越倾向于重新定位以充分利用生物技术和基因组技术来拓展商业农用市场。与此同时，先前专门为制药业服务的基因组技术公司现在也重新定位为“全方位服务”的公司，并开始与农业公司结成联盟。     

中国南荻基因组大片段人工细菌染色体文库的构建

以二倍体中国南荻为实验材料,以pIndigoBAC536-S为载体,以HindIII为限制性内切酶,经过载体的制备、高质量大片段DNA的获得、部分酶切最佳条件的确定、2次大片段选择和连接转化等过程,成功构建了中国南荻人工细菌染色体(bacterial artificial chromosome,BAC)文库。该文库共包含130 560个克隆,空载率为2%,同时构建了340个超级池,便于以后针对目的基因片段的BAC筛选。对随机挑取的100个单克隆检测,结果显示,插入片段分布集中,平均大小为106kb,覆盖了南荻基因组的5.6倍。随机挑取的5个克隆经过100代左右的繁殖,DNA的酶切图谱保持一致,表明BAC克隆的稳定性良好。该文库能够为该品种的基因组研究提供1个有效的平台,将对芒属植物优良基因的克隆、基因组物理图谱的构建以及比较基因组学等方面的研究发挥重要作用。     

中日合作开展音乐作品开发与提供网络内容服务

(2009-以色列)技术简介:最近几十年,生物数据的数量和质量产生了爆炸式的增长,包括人的基因组序列和高输出量的基因表达式化验。从表面看来,这些方面的发展为生物反     

黑曲霉基因组测序计划完成

荷兰工业化学公司DSM已经完成了一项测序黑曲霉（Aspergillus niger CBS513．88）基因组的合作计划。DSM公司利用这种黑曲霉来生产酶和其他化合物。