面向真实图像噪声的两阶段盲去噪

目的 现有的深度图像去噪算法在去除加性高斯噪声上效果显著,但在去除任意分布的真实图像噪声时表现不佳;去噪模型的深度在不断增加,但去噪效果上却并未能显著提高。对此,设计了一种简单有效的两阶段深度图像去噪算法。方法 首先基于注意力机制估计真实图像上的噪声分布水平,然后使用一个混合膨胀卷积和普通卷积的多尺度去噪模块进行非盲降噪。结果 在DND（darmstadt noise dataset）、SIDD（smartphone image denoising dataset）、Nam和PolyU（the Hong Kong Polytechnic University）等4个图像去噪领域常用数据集上进行去噪实验,选择峰值信噪比（peak signal-to-noise ratio,PSNR）和结构相似性（structual similarity,SSIM）作为去噪效果的评价指标,得到的平均PSNR值分别为39.23 dB,38.54 dB,40.45 dB,37.34 dB,并与几种传统去噪方法和基于深度学习的去噪方法进行比较。实验结果表明,本文的去噪算法在去噪效果和视觉质量上有明显提升。同时,在SIDD数据集上进行消融实验以验证算法中模块的有效性。结论 本文算法使用的跳跃连接、噪声水平估计以及多尺度模块均可以有效提升真实图像去噪效果。与现有方法相比,本文算法不仅能有效去除真实图像噪声,而且能通过简单的模块参数设置控制去噪网络的计算效率。     

联合ZINB模型与图注意力自编码器的自优化单细胞聚类

单细胞数据聚类在生物信息分析中具有重要作用,但受测序原理和测序平台的限制,单细胞数据集普遍存在高维稀疏性、高方差噪声和基因数据缺失的问题,导致单细胞数据在聚类分析和应用方面仍面临诸多挑战。现有的单细胞聚类方法主要针对细胞和基因表达间的关系进行建模,忽略了对细胞间潜在特征关系的充分挖掘以及对噪声的去除,导致聚类结果不理想,从而阻碍了后期对数据的分析。针对上述问题,提出了一种联合零膨胀负二项(Zero Inflated Negative Binomial, ZINB)模型与图注意力自编码器的自优化单细胞聚类算法(Self-optimized Single Cell Clustering Using ZINB Model and Graph Attention Autoencoder, scZDGAC)。该算法首先使用ZINB模型并结合可扩展的DCA去噪算法,通过ZINB分布更好地拟合数据特征分布,提升自编码器的去噪性能,并减小噪声和数据丢失对KNN算法输出的影响;然后通过图注意力自编码器在不同权重的细胞之间传播信息,更好地捕获细胞间的潜在特征进行聚类;最后scZDGAC采用自优化的方法使原...