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通过平均核苷酸一致性分析、基因预测、泛基因组构建、功能注释等流程,以66 株解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)的基因组为对象,进行该物种的泛基因组分析。平均核苷酸一致性分析表明,上述菌株可划为具有明显物种边界的两个独立分支;获得的泛基因组共包含13 051 个基因,其中核心基因2 165 个;碳水化合物活性酶(carbohydrate-active enzymes,CAZy)功能注释显示,B.amyloliquefaciens 相比Bacillus 属内其他菌株在分解淀粉、β-葡聚糖和木聚糖上具有较大优势;在促植物生长方面,B.amyloliquefaciens 通过吲哚丙酮酸途径合成吲哚乙酸,并通过碱性磷酸脂酶和植酸酶分解磷元素;抗生素耐药性分析发现,多数菌株含链霉素以及大环内酯类抗生素抗性基因。此外,在所有基因组中均发现杆菌烯和杆菌肽等次级代谢产物基因簇。上述研究进一步明确B.amyloliquefaciens 基因组水平的分类学特点、核心基础代谢特征,以及菌株在碳水化合物代谢、植物促生、生物防治等方面的优势及潜力,可为开发利用该菌作参考。  相似文献   
2.
为利用超声处理改善κ卡拉胶的溶解性,采用不同超声时间(0~240 min)对κ卡拉胶进行处理。研究超声处理对卡拉胶分子量、还原糖含量、溶解性、热稳定性、流变性和凝胶质构性等功能性质的影响,从而总结超声对κ卡拉胶结构和功能性质的作用机制。研究发现κ卡拉胶分子量、还原糖含量和溶解性的变化受超声时间影响较大。超声处理可明显降低分子量,超声60 min后,样品常温水溶性指数可达98.91%。通过检测样品还原糖含量随超声时间的变化规律可以发现,超声作用可以使κ卡拉胶发生解聚和部分降解从而改善其溶解性。流变和凝胶质构分析表明超声处理可以调节样品的黏弹性。超声处理前κ卡拉胶是硬而脆的凝胶,具有一定泌水性,而超声处理之后,样品的持水性增强,但是热稳定性有所降低。从电镜扫描结果看超声会改变样品表观形态。随着超声时间的延长,κ卡拉胶表面褶皱逐渐伸展,表面变得光滑,其显微结构呈片状。综上所述,超声处理是改善包括κ卡拉胶在内的多糖溶解性的有效方法,可以对κ卡拉胶的流变性、凝胶性等产生一定调节作用,增强持水性,但也会造成热稳定性降低。  相似文献   
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